成年小鼠肺内皮细胞表达数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE129775

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症患者发生医院获得性肺部感染的风险增加，这可能归因于脓毒症后免疫抑制，即所谓的代偿性抗炎反应综合征（CARS）。CARS被认为与白细胞功能障碍有关，而内皮细胞的作用尚不明确。肺循环内衬着一层内皮糖萼，这是一种富含硫酸乙酰肝素的层状结构，对肺稳态至关重要。硫酸乙酰肝素降解在脓毒症早期即发生，导致肺损伤。随后内皮细胞合成新的硫酸乙酰肝素，使糖萼得以重建、内皮得以恢复。我们假设，重建后的内皮糖萼发生重塑——由负责硫酸乙酰肝素合成的内皮机制改变所介导——促进了CARS的发生。我们的CARS实验动物模型重现了脓毒症后免疫抑制，并同时伴有内皮糖萼硫酸乙酰肝素的结构性重塑。

我们使用微阵列技术来鉴定哪种硫酸乙酰肝素修饰酶负责脓毒症后重建的糖萼的重塑，该糖萼的特征是富含在葡萄糖胺6-O位硫酸化的硫酸乙酰肝素二糖。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。