饮食诱导肥胖对高氧性肺损伤的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE123938

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

背景：肥胖已成为全球关注的健康问题。急性呼吸窘迫综合征（ARDS）占重症监护病房总入院人数的10.4%，且死亡率极高。肥胖患者中ARDS的发病率升高。将啮齿类动物暴露于高氧环境可模拟ARDS患者中观察到的许多临床和病理特征。本研究旨在确定高脂饮食诱导的肥胖对小鼠高氧性急性肺损伤易感性的影响。方法：雄性C57BL/6小鼠分别接受60%脂肪饮食或成分匹配的10%脂肪饮食。将小鼠暴露于>95%氧气以诱导肺损伤。从肺匀浆中分离RNA，并通过将RNA测序结果与小鼠Mitocarta（一个编码线粒体定位蛋白的基因清单）进行比较，我们鉴定出脂肪酸合酶（FASN）——一种催化脂肪酸从头合成的酶——是随饮食和高氧暴露而显著变化的线粒体基因之一。我们利用他莫昔芬诱导型Cre重组酶构建体（FASNflox/flox SPC Cre+/-）制备了肺泡上皮细胞FASN缺陷小鼠，并将其暴露于高氧环境和高脂饮食。

结果：接受60%脂肪饮食的小鼠体重、血清胆固醇和空腹血糖显著升高。高脂饮食小鼠的生存率显著降低，肺损伤加重，通过BAL蛋白和LDH、组织学和TUNEL染色评估。通过对肺匀浆进行RNA测序，我们发现FASN是线粒体基因之一，在60%脂肪饮食小鼠中较10%脂肪饮食小鼠显著降低，并在高氧条件下进一步降低。我们通过免疫印迹和免疫组化证实，高脂饮食小鼠肺中FASN蛋白水平较低。在高氧暴露48小时后，FASNflox/flox SPC Cre+/-小鼠表现出BAL蛋白和LDH水平升高以及更严重的组织学肺损伤。FASNflox/flox SPC Cre+/-小鼠在高氧后仍更易发生肺损伤

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。