携带Hermansky-Pudlak综合征相关突变的3D肺类器官EPCAM+上皮细胞全基因组表达分析

该数据集来自NCBI GEO,聚焦携带Hermansky-Pudlak综合征相关突变的3D人肺类器官来源EPCAM+上皮细胞,通过高通量测序进行全基因组表达谱分析

geo
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基因组分类GPL167919606
GSE121999: Genome-wide expression analysis of EPCAM+ epithelial cells from 3-dimensional lung organoids harboring Hermansky-Pudlak Syndrome-associated mutations

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

携带Hermansky-Pudlak综合征相关突变的3D肺类器官EPCAM+上皮细胞全基因组表达分析

Genome-wide expression analysis of EPCAM+ epithelial cells from 3-dimensional lung organoids harboring Hermansky-Pudlak Syndrome-associated mutations

该数据集来自NCBI GEO,聚焦携带Hermansky-Pudlak综合征相关突变的3D人肺类器官来源EPCAM+上皮细胞,通过高通量测序进行全基因组表达谱分析。数据包含1个文件(GSE121999_series_matrix.txt.gz),物种为人类(9606),平台为GPL16791。该数据可用于研究HPS相关突变对肺上皮细胞转录组的影响,并支持疾病建模与表达谱比较分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 30 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):通过CRISPR/Cas9基因组编辑引入Hermansky-Pudlak综合征相关突变,可在hPSC来源肺类器官的3D培养中进行疾病建模。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121999

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 25 201,引用时请注意版本时效。

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数据说明

利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术引入Hermansky-Pudlak综合征相关突变,可在hPSC来源的肺类器官3D培养中进行疾病建模。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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