戒烟者肺组织表达数据

该数据集为来自戒烟者肺组织的基因表达数据,采用表达谱芯片技术,平台为GPL96,物种为9606(人类)。数据可用于研究戒烟后肺组织的基因表达特征,支持差异表达分析与分类建模等任务(来源 NCBI)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL969606
GSE119040: Expression data from lung tissue of exsmokers

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

戒烟者肺组织表达数据

GSE119040 是一个聚焦于戒烟者肺组织基因表达的研究型数据集,英文标题为“Expression data from lung tissue of exsmokers”,由 Sandra Grumelli 提交,数据托管于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。该数据集收录了来自戒烟人群肺组织的基因表达谱信息,采用表达谱芯片技术进行检测,平台编号为 GPL96,物种为人类(9606)。数据集在本站归入“呼吸系统疾病 / 其他”分类,整体以单个压缩文件的形式提供下载,文件名为 GSE119040_series_matrix.txt.gz。该数据可用于考察戒烟后肺组织的基因表达特征,并支持差异表达分析、分类建模等下游研究任务。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI,源站标题为“Expression data from lung tissue of exsmokers”,源站对其的描述为“Gene expression of lung tissue from ex-smokers”。从标题与描述可以看出,该数据关注的是戒烟者这一特定人群的肺组织基因表达情况。戒烟是呼吸系统疾病研究中的重要暴露因素,肺组织作为直接受吸烟影响的靶器官,其表达谱变化具有研究价值。数据集作者为 Sandra Grumelli,发布时间记录为 Aug 24 201。

【数据内容】

数据集的核心内容是来自戒烟者肺组织的基因表达数据,采用表达谱芯片(Expression profiling by array)技术产生,检测平台为 GPL96,物种为人类(9606)。数据以系列矩阵文件的形式组织,文件样例为 GSE119040_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。整个数据集仅包含 1 个文件,即上述系列矩阵压缩包,其中汇集了样本层面的表达信息。关于样本数量、分组设计、具体基因数量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据采集自戒烟者的肺组织样本,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 基因表达数据库中的系列记录。数据集由 Sandra Grumelli 提交,发布时间为 Aug 24 201。除上述信息外,关于样本采集地点、采集时间跨度、伦理审批与知情同意等具体流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究戒烟后肺组织的基因表达特征,可支撑差异表达分析,用于识别戒烟者肺组织中表达发生变化的基因;也可用于分类建模等任务,例如基于表达谱构建样本分类或特征筛选模型。由于主题涉及呼吸系统疾病,该数据还可作为呼吸系统相关研究中关于戒烟暴露的参考表达谱资源。具体的分析目标与建模方案需结合研究者自身设计确定,源站未提供推荐的分析流程或结论。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE119040_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包,需按对应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认无误后再批量接入完整数据,以避免因格式或编码问题导致解析错误。读取后的表达矩阵可结合平台信息 GPL96 进行基因注释与后续分析。源站未提供更详细的使用说明或配套脚本。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模与样本构成信息有限,源站未提供样本量、分组平衡性、数据质控指标等细节。由于数据来源于戒烟者肺组织,其结论的适用范围应限定在该人群与组织类型范围内。关于批次效应、缺失值处理及标准化方法等信息,源站未提供,使用者在分析前应自行评估数据质量。

【引用与许可】

数据来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov,提交者为 Sandra Grumelli,发布时间为 Aug 24 201。关于该数据集的具体引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供,使用者在引用与再分发前应查阅源站页面获取权威说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE119040

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Gene expression of lung tissue from ex-smokers

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