肺气肿肺组织基因表达谱数据集

资源简介

肺气肿肺组织基因表达谱数据集

GSE1122 是一个围绕肺气肿肺组织基因表达谱构建的公开数据集，英文全称为 Emphysema Lung Tissue Gene Expression Profiling，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），在本站归类于呼吸系统疾病 / 其他。该数据集以基因表达谱分析为核心，比较了未患病肺组织、普通肺气肿肺组织以及 Alpha-1 抗胰蛋白酶缺乏症相关肺气肿肺组织的表达情况，为研究肺气肿不同亚型之间的分子差异提供了数据基础。数据集整体规模精简，包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE1122_series_matrix.txt.gz，主题涉及 Expression profiling by array、GPL80 与 9606，作者为 Heiko A. Golpon，发布时间为 Mar 09 200。

【数据集背景】

肺气肿是一种以肺泡结构破坏为特征的呼吸系统疾病，其发生发展涉及复杂的基因表达改变。Alpha-1 抗胰蛋白酶缺乏症相关肺气肿与所谓“普通”肺气肿在病因上存在差异，前者具有明确的遗传基础。该数据集正是针对这一背景，对未患病肺组织（NML）、“普通”肺气肿肺组织（EML）以及 Alpha-1 抗胰蛋白酶缺乏症相关肺气肿肺组织（ADL）进行基因表达谱分析，旨在从转录层面刻画不同肺气肿类型与正常肺组织之间的表达特征。源站标题为 Emphysema Lung Tissue Gene Expression Profiling，直接点明了研究的对象与数据类型。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE1122_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件承载的是肺组织样本的基因表达谱信息，覆盖未患病、普通肺气肿以及 Alpha-1 抗胰蛋白酶缺乏症相关肺气肿三类肺组织。主题标签中的 Expression profiling by array 表明数据通过芯片表达谱技术获得，GPL80 指向所使用的芯片平台，9606 则对应人类物种标识。数据集以系列矩阵形式组织，便于使用者按样本与基因维度读取表达数值。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI，源站描述明确指出其内容为未患病（NML）、“普通”肺气肿（EML）以及 Alpha-1 抗胰蛋白酶缺乏症相关肺气肿（ADL）肺组织的基因表达谱。作者为 Heiko A. Golpon，发布时间为 Mar 09 200。除上述来源与作者信息外，样本采集地点、采集时间、伦理审批等具体细节源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病尤其是肺气肿相关的转录组研究，可用于比较不同肺气肿类型与未患病肺组织之间的基因表达差异，探索 Alpha-1 抗胰蛋白酶缺乏症相关肺气肿与普通肺气肿在分子层面的异同，也可作为基因表达谱分析方法验证、差异表达分析流程测试以及肺气肿生物标志物探索的辅助数据。主题标签所体现的芯片表达谱属性，使其适合在芯片数据分析和比较研究中使用。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE1122_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式，确认样本分组、基因标识与表达数值的对应关系无误后，再批量接入完整数据开展后续分析。由于文件为系列矩阵格式，读取时需注意其表头与注释信息，确保样本标签与三类肺组织分组正确对应。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，规模较为精简，样本量与具体分组数量在现有信息中未予说明。数据以芯片表达谱形式提供，其质量取决于原始实验与平台特性，源站未提供额外的质控指标或批次信息。使用时应注意数据集仅覆盖三类肺组织比较，结论外推需谨慎。发布时间标注为 Mar 09 200，年份信息不完整，源站未提供更精确的发布说明。

【引用与许可】

作者为 Heiko A. Golpon，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。除作者与来源信息外，该数据集的引用格式、许可条款与使用限制源站未提供，使用者在引用或再分发前应自行查阅源站的相关说明。