非结核分枝杆菌肺病患者全基因组关联研究

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦非结核分枝杆菌肺病患者的遗传易感性研究。研究开展全基因组关联研究(GWAS),纳入非结核分枝杆菌肺病患者与健康对照,病例与对照比例为 1:3,年龄、性别匹配的对照组将招募自 Korean Healthy Twin Study

Seoul National University HospitalSeoul National University Hospital
clinicaltrials
浏览 7
基因组分类Mycobacterium Infections, Nontuberculous
Genome-Wide Association Study in Patients With Nontuberculous Mycobacterial Lung Disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

非结核分枝杆菌肺病患者全基因组关联研究

该数据集英文名为 Genome-Wide Association Study in Patients With Nontuberculous Mycobacterial Lung Disease,来源于 clinicaltrials.gov,聚焦非结核分枝杆菌(NTM)肺病患者的遗传易感性研究。非结核分枝杆菌是广泛存在于环境中的微生物,NTM 肺病的发病呈上升趋势,但患者对该病的遗传易感性尚未被明确。为阐明这一问题,研究开展全基因组关联研究(GWAS),纳入 NTM 肺病患者与健康对照,病例与对照比例为 1:3,年龄、性别匹配的对照组将招募自 Korean Healthy Twin Study。该数据集在本站归入呼吸系统疾病 / 其他分类,主题标签为 Mycobacterium Infections, Nontuberculous。

【数据集背景】

非结核分枝杆菌是普遍存在于环境中的微生物。源站描述指出,NTM 肺病的发病正在增加,然而该病患者群体的遗传易感性尚未被识别。正是这一研究空白构成了本数据集所对应研究的出发点:通过全基因组关联研究的方法,考察宿主遗传因素与 NTM 肺病易感性之间的关联。研究以 NTM 肺病患者为病例组、以健康人群为对照组,试图在基因组层面寻找与疾病易感性相关的线索。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集对应的研究内容为一项全基因组关联研究(GWAS),研究对象包括 NTM 肺病患者与健康对照,病例与对照的比例设定为 1:3。对照组在年龄和性别上与病例匹配,并将从 Korean Healthy Twin Study 中招募。源站描述所涉及的疾病条件为 Mycobacterium Infections, Nontuberculous。除上述研究设计与对象构成信息外,源站未提供该数据集所包含的具体变量、检测平台、样本量数值或统计结果等内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov。研究对象中的病例为 NTM 肺病患者,健康对照按 1:3 的病例对照比例设置,并采用年龄、性别匹配的方式,对照组成员招募自 Korean Healthy Twin Study。源站未提供具体的招募地点、招募时间窗口、样本采集流程与基因分型方法等细节。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与非结核分枝杆菌肺病遗传易感性相关的研究场景,尤其是围绕全基因组关联分析设计的病例对照研究,例如探讨宿主遗传变异与 NTM 肺病易感性之间关联的分析。其年龄、性别匹配且对照来源于 Korean Healthy Twin Study 的设计特点,也可为关注匹配设计与对照来源的研究提供参考。源站未提供其他具体适用场景的说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据获取方式、访问权限、分析流程或配套文档等信息。

【质量与限制】

该数据集对应的研究采用病例对照设计,病例与对照比例为 1:3,对照在年龄和性别上与病例匹配,对照来源于 Korean Healthy Twin Study。源站未提供样本量数值、基因分型质量指标、统计效力评估或数据完整性说明,因此无法据此判断数据质量水平。使用时应以源站后续公布的信息为准。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT02832843

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:非结核分枝杆菌感染。非结核分枝杆菌(NTM)是普遍存在的环境微生物。NTM肺病发病率正在上升,然而,该病患者的遗传易感性尚未明确。为了阐明NTM肺病的遗传易感性,研究人员将开展一项全基因组关联研究(GWAS),纳入NTM肺病患者和健康对照者(病例:对照 = 1:3)。年龄、性别匹配的对照组将从韩国健康双胞胎研究中招募。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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