临床轻中度COPD单细胞水平基因表达谱
该数据集为临床轻中度COPD的单细胞水平基因表达谱,来源于omicsdi.org,归类于呼吸系统疾病。源站描述显示研究纳入11例诊断为轻或中度COPD的患者,以及7名年龄匹配的对照个体

基本信息
资源简介
临床轻中度COPD单细胞水平基因表达谱
该数据集为临床轻中度慢性阻塞性肺疾病(COPD)在单细胞水平上的基因表达谱,来源于omicsdi.org,在分类上归属于呼吸系统疾病。根据源站描述,该研究纳入了一个由11例被诊断为轻度或中度COPD的患者组成的队列,同时设置了由7名年龄匹配个体组成的对照组。数据集以转录组学为主题标签,整体围绕临床轻中度COPD患者与年龄匹配对照之间的单细胞基因表达特征展开,属于呼吸系统疾病领域中单细胞转录组层面的数据资源。
【数据集背景】
慢性阻塞性肺疾病是一种常见的呼吸系统疾病,临床上有轻度、中度等不同严重程度的划分。该数据集聚焦于临床轻中度COPD,试图在单细胞水平上刻画基因表达谱。源站描述表明,研究设计包含11例确诊为轻度或中度COPD的患者,并设置了7名年龄匹配的对照个体,通过病例与对照的对照设计来支撑研究。数据集的主题标签为转录组学,说明其核心内容属于基因表达层面的转录组研究。
【数据内容】
该数据集的内容为临床轻中度COPD的单细胞水平基因表达谱。从名称与主题标签来看,数据涉及单细胞层面的转录组学测量结果,即对单个细胞进行基因表达层面的刻画。源站描述仅说明了研究队列由11例轻中度COPD患者与7名年龄匹配对照组成,未进一步提供所测细胞类型、细胞数量、基因数量、表达矩阵形式等具体内容,源站未提供这些细节。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。源站描述显示,研究纳入11例被诊断为轻度或中度COPD的患者,以及7名年龄匹配的对照个体,对照组在年龄上与病例组相匹配。关于样本采集的具体部位、采集时间、测序平台、建库方法、数据处理流程等信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其单细胞转录组学属性与轻中度COPD的临床背景,该数据集可用于在单细胞水平上观察轻中度COPD患者与年龄匹配对照之间基因表达特征的差异,服务于呼吸系统疾病相关的转录组学研究。由于源站描述仅给出队列构成,未说明数据的具体分析用途或验证结论,因此更细化的应用方向源站未提供。
【使用方法】
该数据集以单细胞水平基因表达谱的形式提供,使用者可围绕病例组与对照组的单细胞转录组数据开展表达层面的比较分析。关于数据文件格式、下载方式、预处理步骤、分析工具与参数等使用层面的具体说明,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述明确了研究队列规模为11例轻中度COPD患者与7名年龄匹配对照,样本量相对有限,且疾病严重程度限定在轻度至中度范围,不涵盖重度COPD人群。关于数据质量评估指标、批次效应、测序深度、细胞质控标准等信息,源站未提供。使用时应结合源站描述所限定的队列构成理解其适用范围。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款与数据访问限制,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE279570
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该研究纳入了一个由11名被诊断为轻度或中度COPD的患者组成的队列,以及一个由7名年龄相匹配的个体组成的对照组。
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