三种人类肠道菌群粪菌移植至无菌小鼠致其后代炎症加重与肺功能下降
该数据集来自 search.dataone.org，主题为粪菌移植（FMT）与呼吸系统疾病。研究将来自湿疹婴儿（以 Enterobacteriaceae 为主）和非湿疹婴儿（以 Bacteroidaceae 为主）的肠道菌群移植到无菌 C57BL/6 小鼠，并传递至后代，在非过敏（PBS）与过敏（H
基本信息
资源简介
三种人类肠道菌群粪菌移植至无菌小鼠致其后代炎症加重与肺功能下降
Fecal microbiota transplants (FMT) of three distinct human communities to germ-free mice exacerbated inflammation and decreased lung function in their offspring
该数据集来自 search.dataone.org，主题为粪菌移植（FMT）与呼吸系统疾病。研究将来自湿疹婴儿（以 Enterobacteriaceae 为主）和非湿疹婴儿（以 Bacteroidaceae 为主）的肠道菌群移植到无菌 C57BL/6 小鼠，并传递至后代，在非过敏（PBS）与过敏（HDM）条件下检测气道功能。数据涵盖 16S V4 微生物组与小鼠肺功能相关记录，可用于探究生命早期肠道菌群对出生后呼吸功能及 2 型炎症的影响（来源 DataONE，Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：尽管过敏症急剧增加，但人们对生命早期肠道菌群对出生后呼吸功能的影响知之甚少。我们假设，来自湿疹婴儿的以 Enterobacteriaceae 为主的肠道菌群会增加移植小鼠的 2 型炎症并降低肺功能，而来自非湿疹婴儿的以 Bacteroidaceae 为主的肠道菌群则具有保护作用。来自湿疹婴儿“Infant A”和非湿疹婴儿“Infant B”的 FMT 被成功移植到无菌 C57BL/6 小鼠中，并原样传递至后代。在非过敏（PBS）和过敏（HDM）条件下，测试了 Infant A 和 B、成人 C-人源（阳性对照）和小鼠（阴性对照）菌群在 C57BL/6 小鼠中对气道功能的影响。与小鼠菌群对照相比，携带人类菌群（HUmicrobiota）的小鼠基线肺力学显著受损（
【主题与分类】
主题标签：fecal transplant、16S V4、Microbiome、Mice、lung function。本站分类：呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ae1d44bb9f4d0a9ee3cbaaccd3b7d1eba0160a7b425805c9204f19fcc4e000936
使用许可：Creative Commons Zero v1.0 Universal。
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- OpenDataLab:
数据说明
尽管过敏性疾病急剧增加，但人们对生命早期肠道微生物群对出生后呼吸功能的影响知之甚少。我们假设，来自湿疹婴儿以肠杆菌科为主的肠道微生物群会加重移植小鼠的2型炎症并降低肺功能，而来自非湿疹婴儿以拟杆菌科为主的肠道微生物群则具有保护作用。来自湿疹婴儿“婴儿A”和非湿疹婴儿“婴儿B”的粪菌移植（FMT）成功移植到无菌C57BL/6小鼠体内，并原样传递至子代。在非过敏（PBS）和过敏（HDM）条件下，对C57BL/6小鼠中婴儿A和B、成人C-人源（阳性对照）和小鼠（阴性对照）微生物群对气道功能的影响进行了测试。
与小鼠微生物群对照组（MOmicrobiota）相比，无论是否给予HDM，携带人类微生物群（HUmicrobiota）小鼠的基线肺力学均显著受损；呼吸系统阻力（Rrs）升高（p< 0.05-p< 0.01）……在实验终点收集了接受怀特岛第三代出生队列3月龄婴儿粪便材料移植的C57BL/6无菌小鼠的粪便颗粒。使用FastDNA SPIN试剂盒分离细菌DNA，随后使用Illumina MiSeq对16S rRNA V4区域进行测序，采用MiSeq v2流动池和500循环MiSeq v2试剂盒，双端250碱基读长。碱基识别由Illumina Real Time Analysis (RTA) v1.18.54完成，RTA输出经Illumina Bcl2fastq v1.8.4去多重化并转换为FastQ格式文件。
Illumina测序获得109,085条高质量reads——每组平均reads数：3896（最少3245，最多5053）。Â , , # 将三种不同人类菌群粪便微生物移植（FMT）至无菌小鼠，加剧了其子代炎症并降低肺功能 https://doi.org/10.5061/dryad.zkh1893m9 ## t的描述
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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