宿主适应型铜绿假单胞菌PmrB功能丧失相关的进化权衡

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD009705

标准获取流程：

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数据说明

铜绿假单胞菌定植于囊性纤维化（CF）患者的上气道，提供了一个宿主适应性基因型的储库，这些基因型随后建立慢性肺部感染。我们此前在呼吸道感染小鼠模型中对铜绿假单胞菌进行了实验进化，观察到pmrB中的突变促进了感染的建立和持续。在此我们表明，pmrB（编码PmrAB双组分系统的感受器激酶）中的突变在感染早期即被获得，并增加对宿主抗菌酶溶菌酶的耐药性。对pmrB突变体的蛋白质组学分析显示，相对于野生型菌株LESB65，参与LPS生物合成、抗菌耐药性和吩嗪产生的蛋白质下调，而参与黏附、溶菌酶耐药性和抑制氯离子通道CFTR的蛋白质上调。相应地，pmrB突变体表现出对气道上皮细胞黏附增强，并下调宿主CFTR表达。P.

铜绿假单胞菌pmrB突变见于CF患者分离株，并与相同表型相关，但受到进化权衡的制约：定植潜力增强、对宿主防御的抵抗力和CFTR抑制作用增强，但与此同时对抗生素的敏感性也增加。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。