益生菌对分泌性中耳炎儿童鼻咽微生物组的影响
该数据集来自clinicaltrials.gov，研究益生菌摄入4周后分泌性中耳炎（OME）儿童上呼吸道（鼻咽、腺样体和中耳积液）微生物群的变化
基本信息
资源简介
益生菌对分泌性中耳炎儿童鼻咽微生物组的影响
该数据集英文名为 Effect of Probiotics on Nasopharyngeal Microbiome of Children With Otitis Media With Effusion，来源于 clinicaltrials.gov，本站将其归入呼吸系统疾病 / 其他分类。数据集围绕分泌性中耳炎（Otitis Media With Effusion，OME）儿童展开，关注益生菌摄入对患儿上呼吸道微生物群的影响。研究涉及的条件包括分泌性中耳炎、益生菌以及腺样体增殖（Adenoid Vegetations）。其核心目的是考察 OME 患者在连续 4 周摄入益生菌产品后，上呼吸道各部位——鼻咽、腺样体和中耳积液——的微生物群是否发生改变。为实现这一目标，研究将从拭子、液体和组织样本中提取细菌 DNA，并借助 Illumina MiSeq 测序识别样本中存在的细菌种类，同时通过 qPCR 监测特定病原体的浓度。该数据集适合用于探索益生菌干预与儿童上呼吸道微生态之间关系的分析场景。
【数据集背景】
分泌性中耳炎是儿童群体中常见的耳部疾病，其发生与上呼吸道微生物群的构成可能存在关联。该数据集所对应的研究以益生菌为干预因素，聚焦 OME 患儿的上呼吸道微生态，试图回答益生菌产品摄入是否能够改变鼻咽、腺样体及中耳积液中的微生物群组成。研究同时关注腺样体增殖这一条件，并将其与分泌性中耳炎、益生菌共同列为研究涉及的条件。整体来看，该数据集的背景建立在“益生菌摄入—上呼吸道微生物群变化”这一研究问题上，属于呼吸系统疾病领域下与耳鼻喉及微生态交叉的研究主题。
【数据内容】
数据集的内容围绕上呼吸道微生物群的检测展开。样本类型包括拭子、液体和组织，覆盖鼻咽、腺样体和中耳积液三个部位。检测内容包括两部分：一是通过 Illumina MiSeq 测序对样本中的细菌 DNA 进行分析，以识别存在的细菌种类；二是通过 qPCR 监测特定病原体的浓度。研究的时间维度体现为益生菌产品摄入 4 周后对微生物群变化的观察。主题标签包括 Otitis Media With Effusion、Probiotics 和 Adenoid Vegetations。除上述内容外，关于样本量、具体菌种列表、测序数据规模等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 clinicaltrials.gov。研究样本取自 OME 患儿的上呼吸道，具体包括鼻咽拭子、中耳积液以及腺样体组织等。细菌 DNA 的提取使用市售的 DNA 提取试剂盒完成，随后进行 Illumina MiSeq 测序；特定病原体的浓度则通过 qPCR 进行监测。关于采集时间点、随访安排、样本保存与运输条件等操作细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究与益生菌干预相关的儿童上呼吸道微生物群变化，适合关注分泌性中耳炎、腺样体增殖与微生态关系的分析工作。潜在应用包括比较干预前后鼻咽、腺样体和中耳积液样本中细菌种类的构成差异，以及结合 qPCR 结果考察特定病原体浓度的变化。由于涉及测序与 qPCR 两类数据，该数据集也适合用于微生物组分析与病原体定量监测相结合的研究场景。关于具体适用分析方法的验证结论，源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时，可围绕研究目的分别处理测序数据与 qPCR 数据：测序数据用于识别样本中的细菌种类，qPCR 数据用于反映特定病原体的浓度。分析中可将样本按部位（鼻咽、腺样体、中耳积液）以及按益生菌摄入 4 周前后的时间点进行组织。关于数据文件格式、字段结构、预处理步骤与统计方法，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 clinicaltrials.gov 的研究描述，涉及的条件与检测方法已明确，但样本量、测序深度、qPCR 靶标清单、质量控制指标等信息源站未提供。研究聚焦于益生菌摄入 4 周后的微生物群变化，其结论的适用范围受研究设计与样本特征约束。关于数据完整性、缺失情况与偏倚控制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 clinicaltrials.gov。关于引用格式、许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03277820
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件：渗出性中耳炎、益生菌、腺样体增殖。本研究旨在探究渗出性中耳炎（OME）患者上呼吸道（鼻咽、腺样体及中耳积液）中的微生物群在摄入益生菌产品4周后是否发生变化。因此，将通过市售DNA提取试剂盒从拭子、液体和组织中分离细菌DNA，随后进行Illumina MiSeq测序，以鉴定这些样本中存在的细菌种类。此外，将通过qPCR监测特定病原体的浓度。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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