miR-144/miR451表达对TC-1肺上皮细胞流感感染24小时应答的影响 [RT-PCR]

该数据集来自omicsdi.org,属于呼吸系统疾病/其他分类,主题标签为Transcriptomics。源站描述显示,研究通过RT-PCR分析miR-144/miR451表达对TC-1肺上皮细胞在流感感染24小时后应答的影响,背景涉及小鼠感染流感后肺部microRNA表达谱的检测,用于识别可能调控

omicsdi
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基因组Transcriptomics
Effect of miR-144/miR451 expression on TC-1 lung epithelial cell responses to influenza infection for 24 hours [RT-PCR]

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

miR-144/miR451表达对TC-1肺上皮细胞流感感染24小时应答的影响 [RT-PCR]

该数据集英文名为 Effect of miR-144/miR451 expression on TC-1 lung epithelial cell responses to influenza infection for 24 hours [RT-PCR],来源站为 omicsdi.org,在本站归入呼吸系统疾病 / 其他分类,主题标签为 Transcriptomics。从名称与源站描述看,该数据集围绕 miR-144/miR451 表达对 TC-1 肺上皮细胞在流感感染 24 小时后应答的影响,采用 RT-PCR 方法开展检测;其研究背景涉及宿主抗病毒应答的调控机制,以及通过检测小鼠流感感染后肺部 microRNA 表达谱来识别可能调控宿主反应的 microRNA。以下依据可获得的信息对该数据集作分段介绍。

【数据集背景】

源站描述指出,抗病毒应答必须受到调控,以便既能快速防御感染,又能尽量减少炎症损伤,但感染细胞内应答幅度如何确立的机制尚不十分清楚。microRNA 是一类小型非编码 RNA,可通过结合其同源 mRNA 上的靶序列负向调控蛋白水平。为识别可能调控宿主对流感感染反应的 microRNA,研究对感染流感 A/PR/8/34 24 小时的小鼠肺部 microRNA 表达进行了分析。该数据集即在这一背景下,聚焦 miR-144/miR451 表达与 TC-1 肺上皮细胞流感感染 24 小时应答之间的关系,采用 RT-PCR 进行检测。

【数据内容】

数据集名称明确其检测对象为 miR-144/miR451 表达对 TC-1 肺上皮细胞流感感染 24 小时应答的影响,方法标注为 RT-PCR。源站描述还说明,研究对感染流感的小鼠肺部 microRNA 表达进行了谱型分析,用于识别可能调控宿主反应的 microRNA。除上述信息外,关于数据集所含样本数量、具体检测指标、数据文件类型与组织方式等,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述记载,小鼠经鼻内感染 10e5 pfu 的流感 A/PR/8/34;感染 24 小时后分离肺组织,并使用 Trizol 提取总 RNA;将 3 只感染小鼠的等量 RNA 进行混合。该数据集名称所指向的 TC-1 肺上皮细胞在流感感染 24 小时后的 RT-PCR 检测,与上述小鼠肺部 microRNA 表达谱分析共同构成其研究来源背景。其余采集细节,如具体实验批次、仪器与试剂信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与流感感染后宿主抗病毒应答调控相关的研究场景,尤其是关注 microRNA 负向调控作用、肺部 microRNA 表达谱分析,以及 miR-144/miR451 在肺上皮细胞感染应答中作用的研究。其 RT-PCR 方法属性也使其可用于针对特定 microRNA 表达检测的分析工作。更具体的适用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式说明、分析流程或复现实验步骤等。

【质量与限制】

源站描述提到,用于表达谱分析的小鼠肺组织 RNA 来自 3 只感染小鼠的等量混合样本,这属于样本混合设计;除此之外,关于数据质量评估、技术重复、批次效应或其它限制因素,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-31956

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

抗病毒反应必须受到调控,以便快速防御感染,同时尽量减少炎症损伤,但在受感染细胞内确定反应强度的机制尚不清楚。miRNA是一类小型非编码RNA,通过结合其同源mRNA上的靶序列来负向调节蛋白质水平。我们对感染甲型流感A/PR/8/34株24小时的小鼠肺部microRNA表达进行了分析,以鉴定可能调节宿主对流感感染反应的microRNA。小鼠经鼻内感染10e5 pfu甲型流感A/PR/8/34株。24小时后分离肺部,使用Trizol提取总RNA。将3只感染小鼠的等量RNA混合。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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