远端气道干细胞在H1N1流感感染后肺再生中生成肺泡(干细胞克隆NESC、TASC、DASC)

该数据集来自ebi.ac.uk,主题为转录组表达谱芯片,物种为Homo sapiens,归入呼吸系统疾病/其他分类。源站描述聚焦小鼠H1N1流感病毒感染后肺再生过程:表达p63的细支气管上皮干细胞在感染后快速增殖,迁移至肺泡消融的细支气管间区域,组装成Krt5+细胞团并启动肺泡标志物表达,其基因表达

google_dataset
浏览 7
基因组分类transcription profiling by arrayHomo sapiens
Distal airway stem cells yield alveoli in vitro and during lung regeneration following H1N1 influenza infection (stem cell clones NESC,TASC,DASC)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

远端气道干细胞在H1N1流感感染后肺再生中生成肺泡(干细胞克隆NESC、TASC、DASC)

Distal airway stem cells yield alveoli in vitro and during lung regeneration following H1N1 influenza infection (stem cell clones NESC,TASC,DASC)

该数据集来自ebi.ac.uk,主题为转录组表达谱芯片,物种为Homo sapiens,归入呼吸系统疾病/其他分类。源站描述聚焦小鼠H1N1流感病毒感染后肺再生过程:表达p63的细支气管上皮干细胞在感染后快速增殖,迁移至肺泡消融的细支气管间区域,组装成Krt5+细胞团并启动肺泡标志物表达,其基因表达谱提示这些细胞团是病毒感染破坏的肺泡-毛细血管网络重建的中间体。数据可用于研究远端气道干细胞在严重肺损伤后再生肺泡过程中的转录特征与调控机制(来源 BioStudies)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):灾难性损伤后肺再生的程度以及成体干细胞在此过程中的潜在作用仍不清楚。用与1918年大流行相关的H1N1流感病毒对小鼠进行亚致死性感染,会引发大规模气道损伤,随后出现明显的再生。我们在此表明,细支气管上皮中表达p63的干细胞在感染后迅速增殖,并辐射至肺泡消融的细支气管间区域。到达该处后,这些细胞组装成离散的Krt5+细胞团,并开始表达典型的肺泡标志物。这些细胞团的基因表达谱表明,它们是病毒感染所根除的肺泡-毛细血管网络重建过程中的中间体。这种表达p63的干细胞在肺再生中的动态变化,与我们平行发现的、已定义的人类远端气道s

【主题与分类】

主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-32604

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-32604

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Frank McKeon; Pooja Kumar; Yuanyu Hu; Yusuke Yamamoto; Neo Hoe; Tay Wei; Dakai Mu; Yan Sun; Lim Joo; Rania Daghers; Elisabeth Zielonka; De Wang; Vincent Chow; Christopher Crum; Wa Xian (2011). Distal airway stem cells yield alveoli in vitro and during lung regeneration following H1N1 influenza infection (stem cell clones NESC,TASC,DASC) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-32604

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。