与文章“蛋白质组适配体分析揭示与系统性硬化症疾病机制和表型相关的血清生物标志物”相关的数据集

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源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.10043328

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数据说明

本记录包含与文章“蛋白质组适配体分析揭示与系统性硬化症疾病机制和表型相关的血清生物标志物”相关的数据。背景：系统性硬化症（SSc）是一种影响多器官的自身免疫性结缔组织病，导致发病率和死亡率升高，治疗选择有限。器官受累的早期检测具有挑战性，因为目前尚无血清标志物可用于预测SSc的进展。适配体技术蛋白质组分析具有将SSc表现与高达飞摩尔浓度的血清蛋白相关联的潜力。方法：这是一项两阶段研究，研究对象为SSc女性患者（包括高分辨率CT扫描显示间质性肺病——ILD——的患者）和年龄匹配的健康对照（HC）的血清样本，首先采用基于适配体的蛋白质组分析对超过1300种蛋白质进行分析。所提出的相关蛋白首先在一个独立的SSc患者和HC队列中通过ELISA进行验证，选定的蛋白质再在两个额外队列中进一步验证。

结果：基于适配体的初步蛋白质组学分析鉴定出33种蛋白质，其在SSc患者血清中的浓度与HC血清相比存在显著差异，另有9种蛋白质与SSc-ILD相关，包括参与细胞外基质形成和细胞间黏附、血管生成、白细胞募集、活化及信号传导的蛋白质。在独立队列中的进一步验证最终确认了特定蛋白质与SSc早期发病、特定器官受累及血清自身抗体的关联。结论：我们的多层次蛋白质组学分析鉴定出了可区分SSc患者与HC的血清蛋白质，或与不同SSc亚型、疾病病程及表现（包括ILD、皮肤受累、食管疾病和自身抗体）相关的血清蛋白质。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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