墨西哥瓦哈卡州2023年疑似呼吸道感染病例SARS-CoV-2与流感病毒RT-PCR检测数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.20176251

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.2 MB。

数据说明

本数据集包含2023年1月至6月在墨西哥瓦哈卡州评估的疑似呼吸道病毒感染患者的临床和分子诊断数据。该数据集包括在瓦哈卡州公共卫生实验室（LESPO）分析的1076例疑似COVID-19病例的信息，使用多重实时RT-PCR同时检测：SARS-CoV-2、甲型流感病毒、乙型流感病毒。样本来自瓦哈卡州全部六个卫生辖区：中央谷地、地峡、图斯特佩克、海岸、米斯特卡、山区。该研究纳入符合以下流行病学标准的任何年龄和性别的患者：流感样疾病（ILI）、严重急性呼吸道感染（SARI）。鼻咽和咽拭子使用QIAamp Viral RNA Mini Kit进行核酸提取。分子检测使用Applied Biosystems 7500 FAST平台上的实时RT-PCR进行。该数据集包括人口统计学变量、流行病学信息、RT-PCR Ct值以及SARS-CoV-2和流感病毒的诊断结果。

该数据集是一项研究生研究论文的一部分，该论文聚焦于墨西哥瓦哈卡州呼吸道病毒感染的分子诊断和流行病学特征。该数据集可能有助于：呼吸道病毒流行病学、流感监测、COVID-19监测、诊断测试评估、合并感染分析、公共卫生研究、One Health研究。

3. 方法

这项基于实验室的观察性研究纳入了2023年1月至6月期间提交至瓦哈卡州公共卫生实验室（LESPO）的1076例疑似COVID-19病例。样本采集自符合国家流感样疾病（ILI）和/或严重急性呼吸道感染（SARI）操作定义的患者。

样本采集

鼻咽拭子和咽拭子由经过培训的医护人员从瓦哈卡州六个卫生辖区的公共卫生保健中心采集。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。