MicroCOPD 真菌组描述性研究 2020 数据集
背景：肺部微生物组的真菌部分（真菌组）研究不足。我们在一项大规模单中心支气管镜研究（MicroCOPD）中报告了 COPD 参与者与对照者口腔和肺部真菌组的组成
基本信息
资源简介
MicroCOPD 真菌组描述性研究 2020 数据集
背景：肺部微生物组的真菌部分（真菌组）研究不足。我们在一项大规模单中心支气管镜研究（MicroCOPD）中报告了 COPD 参与者与对照者口腔和肺部真菌组的组成
Dataset for MicroCOPD mycobiome descriptive study 2020
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景：肺部微生物组的真菌部分（真菌组）研究不足。我们在一项大规模单中心支气管镜研究（MicroCOPD）中报告了 COPD 参与者与对照者口腔和肺部真菌组的组成。方法：从 93 名 COPD 参与者和 100 名对照者采集口腔冲洗液和支气管肺泡灌洗液（BAL）。在测序真菌核糖体 RNA 基因簇的内部转录间隔区 1（ITS1）之前提取真菌 DNA。生成分类条形图，并比较研究组之间以及按吸入类固醇使用情况划分的分类组成、Shannon 指数和 beta 多样性。结果：对照者和 COPD 参与者的口腔和肺部真菌组均以 Candida 为主，且两个研究组的口腔样本中 Candida 均多于 BAL。Malassezia 和 Sarocladium 也
【主题与分类】
主题标签：呼吸系统疾病、COPD、真菌组、口腔微生物、支气管肺泡灌洗、ITS1 测序。本站分类：呼吸系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aa5b09ecaa86be3d08b8f42515408dc17711e29bce2f337c40712b1135a91daf4
使用许可：CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景：肺部微生物组中的真菌部分（真菌组）研究不足。我们报告了一项大规模单中心支气管镜检查研究（MicroCOPD）中，COPD参与者与对照组口腔和肺部真菌组的组成。方法：从93名COPD参与者和100名对照者中采集口腔漱洗液和支气管肺泡灌洗液（BAL）。在测序真菌核糖体RNA基因簇的内转录间隔区1（ITS1）之前提取真菌DNA。生成分类学条形图，并比较研究组之间以及按吸入类固醇使用情况分类的分类学组成、Shannon指数和β多样性。结果：对照组和COPD参与者的口腔和肺部真菌组均以念珠菌属为主，且两个研究组的口腔样本中念珠菌属均多于BAL。马拉色菌属和Sarocladium属在肺部样本中也经常被发现。研究组之间未发现一致差异……
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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