ARDS多因素特性数据集：小鼠急性肺损伤“二次打击”模型
该数据集来自 doi.org，聚焦 ARDS 的多因素病理特征，提供小鼠急性肺损伤“二次打击”模型的综合表征。模型将气管内滴注 LPS 或 HCl 与呼吸机诱导肺损伤（VILI）相结合，并设置对照组、低 PIP 通气组等处理组，用于比较二次打击与单纯 VILI 的损伤差异
基本信息
资源简介
ARDS多因素特性数据集：小鼠急性肺损伤“二次打击”模型
Dataset for: Capturing the multifactorial nature of ARDS- “Two-hit” approach to model murine acute lung injury
该数据集来自 doi.org，聚焦 ARDS 的多因素病理特征，提供小鼠急性肺损伤“二次打击”模型的综合表征。模型将气管内滴注 LPS 或 HCl 与呼吸机诱导肺损伤（VILI）相结合，并设置对照组、低 PIP 通气组等处理组，用于比较二次打击与单纯 VILI 的损伤差异。数据集含 2 个文件，配套论文发表于 Physiological Reports（2018）。可用于研究 ARDS 复杂病理机制、验证多因素动物模型及探索叠加性肺损伤（来源 figshare，CC0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Capturing the multifactorial nature of ARDS - “Two-hit” approach to model murine acute lung injury》发表于 Physiological Reports（2018），DOI：10.14814/phy2.13648。源站首次发布：2018-05-07。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：重度急性呼吸窘迫综合征（ARDS）通常以一个初始事件起病，随后需要机械通气。大多数急性肺损伤（ALI）动物模型的局限在于它们只关注单一病因，因而无法模拟 ARDS 复杂、多因素的病理生物学。为更好地呈现这一情形，我们提供了将两种损伤相结合的 ALI 模型的综合表征：气管内（i.t.）滴注 LPS 或次氯酸（HCl），随后进行呼吸机诱导肺损伤（VILI）。我们假设，在 VILI 之前预先接受 LPS 或 HCl 处理、因而受到（“二次打击损伤”）的小鼠，相较于 VILI 会承受超叠加的肺损伤。小鼠被分配至以下处理组：气管内滴注 NaCl 的对照、低吸气峰压（PIP）通气、气管内滴注 HCl、气管内滴注 LPS、VI
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 4.91 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.5909005.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Animal physiology - biophysics、Animal physiology - cell、Animal physiology - systems、Systems biology。主题标签：acute lung injury、murine models、ventilator induced lung injury (VILI)、2 hit lung injury、Physiology、Systems Biology。本站分类：呼吸系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Animal physiology - biophysics、Animal physiology - cell、Animal physiology - systems、Systems biology。
【获取与许可】
源站页面：https://wiley.figshare.com/articles/dataset/Dataset_for_Capturing_the_multifactorial_nature_of_ARDS-_Two-hit_approach_to_model_murine_acute_lung_injury/5909005
使用许可：CC0（https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/）。
规范引用：Hoegl, Sandra; Burns, Nana; Angulo, Martin; Francis, Daniel; Osborne, Christopher; Weng, Tingting; et al. (2018). Dataset for: Capturing the multifactorial nature of ARDS- “Two-hit” approach to model murine acute lung injury. Wiley. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.5909005
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 4.9 MB。
数据说明
重度急性呼吸窘迫综合征（ARDS）通常以一个初始事件起病，随后需要机械通气。大多数急性肺损伤（ALI）动物模型的局限性在于它们仅关注急性肺损伤的单一病因，因而无法模拟ARDS复杂的、多因素的病理生物学特征。为更好地再现这一情况，我们对结合两种损伤的ALI模型进行了全面表征：气管内（i.t.）滴注LPS或次氯酸（HCl），随后施加呼吸机相关性肺损伤（VILI）。我们假设，在VILI之前预先接受LPS或HCl处理、从而遭受“二次打击损伤”的小鼠，相较于单纯VILI，将出现超叠加性肺损伤。小鼠被分配至以下处理组：气管内滴注NaCl的对照组、低吸气峰压（PIP）通气组、气管内滴注HCl组、气管内滴注LPS组、VILI（高PIP）组、气管内滴注HCl后施加VILI组，以及气管内滴注LPS后施加VILI组。损伤严重程度通过支气管肺泡灌洗液（BAL）中的蛋白含量和MPO活性、炎症细胞因子的表达以及组织病理学来判定。
与单一的肺损伤相比，接受盐酸或LPS滴注后经历VILI的小鼠表现出加重的肺损伤。然而，与先接受i.t. HCl随后进行VILI的动物相比，事先接受i.t. LPS再进行VILI的小鼠显示出显著增加的炎症性肺损伤。所描述的两种打击肺损伤模型，导致叠加但差异性的急性肺损伤，重现了ALI临床相关的多因素病因学，并可能成为转化研究中的宝贵工具。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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