2013至2019年广州肺部真菌感染趋势：基于AI的真实世界观察研究数据
该数据集来自tandf.figshare.com，配套2021年发表于Emerging Microbes & Infections的研究，覆盖2013年1月1日至2019年12月31日广州医科大学附属第一医院呼吸系统疾病患者
基本信息
资源简介
2013至2019年广州肺部真菌感染趋势：基于AI的真实世界观察研究数据
Trends of pulmonary fungal infections from 2013 to 2019: an AI-based real-world observational study in Guangzhou, China
该数据集来自tandf.figshare.com，配套2021年发表于Emerging Microbes & Infections的研究，覆盖2013年1月1日至2019年12月31日广州医科大学附属第一医院呼吸系统疾病患者。研究采用自然语言处理系统从电子健康记录中提取信息，筛查40504例住院和219414例门诊患者，识别出1368例住院和1313例门诊肺部真菌感染患者，可用于分析肺部真菌感染的流行病学特征与时间趋势（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Trends of pulmonary fungal infections from 2013 to 2019: an AI-based real-world observational study in Guangzhou, China》发表于 Emerging Microbes & Infections（2021），DOI：10.1080/22221751.2021.1894902。项目资助方：This research was funded by the Independent Fund of the State Key Laboratory of Respiratory Diseases (SKLRD-Z-202019); the First Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University, National Clinical Medical Research Centre 2019 Clinical Autonomous Exploration Project (2019GIRHZ06), the Open Fund of the State Key Laboratory of Respiratory Diseases (SKLRD-OP-201913) and the National Key Technology R&D Program (No. 2018YFC1311900).。源站首次发布：2021-03-13。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：近年来，肺部真菌感染（PFI）的患病率呈快速上升趋势。过去十年间，已有报道涉及某些个体PFI的危险因素变化、相关基础疾病分布及临床特征。然而，关于PFI的数据仍不确定。本研究报道了近年来PFI的流行病学特征及随时间变化的趋势。我们应用自动化自然语言处理（NLP）系统从广州医科大学附属第一医院PFI患者的电子健康记录（EHR）中提取临床相关信息，随后进行趋势分析。从2013年1月1日至2019年12月31日，共筛查40504例住院和219414例门诊呼吸系统疾病患者，其中识别出1368例住院和1313例门诊PFI患者。这些患者
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 753.89 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.14213304.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer、Mental Health。主题标签：Epidemiology、incidence、trends、artificial intelligence、pulmonary fungal infection。本站分类：呼吸系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer、Mental Health。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Trends_of_pulmonary_fungal_infections_from_2013_to_2019_an_AI-based_real-world_observational_study_in_Guangzhou_China/14213304
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Trends of pulmonary fungal infections from 2013 to 2019: an AI-based real-world observational study in Guangzhou, China. Taylor & Francis. Li, Zhengtu; Li, Yongming; Chen, Yijun; Li, Jing; Li, Shaoqiang; Li, Chenglong; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2026-05-21，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Trends of pulmonary fungal infections from 2013 to 2019: an AI-based real-world observational study in Guangzhou, China
- DOI：10.6084/m9.figshare.14213304.v1
- 发布日期：2021-03-13
- 文件数：2 个
- 文件总体积：753.89 KB
- 源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Trends_of_pulmonary_fungal_infections_from_2013_to_2019_an_AI-based_real-world_observational_study_in_Guangzhou_China/14213304
命令行下载
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文件清单
temi_a_1894902_sm0270.tif（707.64 KB）temi_a_1894902_sm0269.docx（46.25 KB）
文件总体积 753.89 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
近年来，肺部真菌感染（PFI）的患病率呈快速上升趋势。过去十年间，已有报道指出某些个体PFI的危险因素、相关基础疾病分布及临床特征发生了变化。然而，关于PFI的数据仍不确定。本研究报道了近年来PFI的流行病学特征及随时间变化的趋势。我们应用自动化自然语言处理（NLP）系统从广州医科大学附属第一医院PFI患者的电子健康记录（EHRs）中提取临床相关信息，随后进行趋势分析。2013年1月1日至2019年12月31日期间，共筛查了40,504例住院和219,414例门诊呼吸系统疾病患者，其中识别出1,368例住院和1,313例门诊PFI患者。这些患者来自全国各地，但大多数来自中国南方。住院和门诊患者中PFI均呈上升趋势（PTalaromyces marneffei，过去被认为不常见，其增幅最为迅速。
在年轻PFI患者中，PFI的发病率和趋势有所增加。既往不常见病原体的感染也逐渐增多。应更加关注年轻PFI患者及不常见PFI病原体感染。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.14213304.v1（source: https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Trends_of_pulmonary_fungal_infections_from_2013_to_2019_an_AI-based_real-world_observational_study_in_Guangzhou_China/14213304）。
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