COPD患者稳定期与急性加重期痰液微生物群及炎症数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.2f25cj0

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数据集大小约 37.0 KB。

数据说明

背景：慢性阻塞性肺疾病（COPD）的急性加重是使人衰弱的事件，并会加速疾病进展。感染性病因较为常见；然而，目前尚不清楚气道微生物群的较大变化在多大程度上导致了急性加重。本研究旨在分析稳定期与急性加重期之间微生物组成的变化及相应的免疫反应。方法：研究样本包括来自卑尔根COPD队列与急性加重研究（Bergen COPD Cohort and Exacerbations studies）的36例在稳定期和急性加重期接受检查的COPD患者，以及1例在三年研究期间于13个不同时间点提供痰液的患者。医生在所有时间点对患者进行检查，并按照严格方案进行诱导痰采集。本研究仅使用诱导痰样本，不使用自然咳出的痰液。在 supernatants 中检测痰液炎症标志物（IL-6、IL-8、IL-18、IP-10、MIG、TNF-α）和抗菌肽（AMPs，即LL-37/hCAP-18、SLPI），同时对相应的细胞沉淀进行目标基因测序（16S rRNA）。

生物信息学分析采用了微生物组生物信息学平台QIIME2TM和统计环境R。结果：两种疾病状态之间，IP-10、MIG、TNF-α及AMPs的水平存在显著差异。在36对样本中，有24对在12种最丰富的菌属上显示出疾病状态间的显著差异。若干个体中的多样性存在显著差异，但在群体水平上分析数据时则未见差异。一例患者案例研究显示，微生物群的纵向动态变化与疾病状态无关。结论：随着COPD疾病状态的变化，痰液微生物群的变化是常见的，并伴有炎症标志物的变化。然而，这些变化是高度个体化和异质性的事件。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。