儿童呼吸道合胞病毒感染疾病严重程度标志物Olfactomedin 4数据集
该数据集来自ebi.ac.uk,包含儿童呼吸道合胞病毒(RSV)感染相关的转录组芯片数据,物种为Homo sapiens

基本信息
资源简介
儿童呼吸道合胞病毒感染疾病严重程度标志物Olfactomedin 4数据集
Olfactomedin 4 serves as a marker for disease severity in pediatric Respiratory Syncytial Virus (RSV) infection
该数据集来自ebi.ac.uk,包含儿童呼吸道合胞病毒(RSV)感染相关的转录组芯片数据,物种为Homo sapiens。源站描述显示研究对26名重症、中症或轻症RSV感染儿童的血液样本进行了流式细胞术和全基因组基因表达分析,差异表达基因在第二个80名儿童队列中经Q-PCR验证,并进行了FACS分析。数据可用于探索RSV感染疾病严重程度的免疫应答机制、筛选候选生物标志物,并支持临床决策相关的分类研究(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):呼吸道病毒感染在幼儿中呈现不可预测的临床过程,从普通感冒到呼吸衰竭不等。从轻症向重症的转变迅速且难以预测。疾病严重程度背后的病理生理机制仍不清楚。迫切需要更好地理解该疾病中的免疫反应,以提出可能有助于临床决策的生物标志物。在一项前瞻性研究中,对26名诊断为重症、中度或轻度呼吸道合胞病毒(RSV)感染儿童的血液样本进行了流式细胞术和全基因组基因表达分析。差异表达基因在连续三个冬季季节的第二个80名儿童队列中使用Q-PCR进行了验证。第二个队列以及第一个队列中重症病例的恢复期样本也进行了FACS分析。
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-69606
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源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-69606
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
Dick de Ridder; Kim Brand; Ingle Ahout; Angela van Diepen; Yunlei Li; Marike Zaalberg; Arno Andeweg; Nel Roeleveld; Ronald de Groot; Adilia Warris; Peter Hermans; Gerben Ferwerda; Frank Staal (2015). Olfactomedin 4 serves as a marker for disease severity in pediatric Respiratory Syncytial Virus (RSV) infection [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-69606
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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