HIV相关阻塞性肺疾病肺部蛋白质组与代谢组内型数据
该数据集来自 search.dataone.org，聚焦 HIV 相关阻塞性肺疾病，包含 26 例合并阻塞性肺疾病 HIV 感染者的支气管肺泡灌洗液样本，并按年龄、吸烟状态和抗逆转录病毒治疗与无阻塞性肺疾病的 HIV 感染者匹配
基本信息
资源简介
HIV相关阻塞性肺疾病肺部蛋白质组与代谢组内型数据
Lung proteome and metabolome endotype in HIV-associated obstructive lung disease
该数据集来自 search.dataone.org，聚焦 HIV 相关阻塞性肺疾病，包含 26 例合并阻塞性肺疾病 HIV 感染者的支气管肺泡灌洗液样本，并按年龄、吸烟状态和抗逆转录病毒治疗与无阻塞性肺疾病的 HIV 感染者匹配。数据基于 SomaScan 适配体检测平台测量 6,414 种蛋白质，采用稀疏距离加权判别分析检验蛋白表达差异，并通过置换检验识别蛋白与 FEV1pp 的单变量关联，显著蛋白进一步用于通路过表达分析。数据可用于 HIV 相关阻塞性肺疾病的蛋白质组与代谢组内型研究（来源 DataONE）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：目的：阻塞性肺疾病在 HIV 感染者中日益常见，吸烟者和非吸烟者均受影响。我们使用适配体蛋白质组学来识别 HIV 相关阻塞性肺疾病中的蛋白质及相关通路。方法：来自 26 名合并阻塞性肺疾病的 HIV 感染者的支气管肺泡灌洗液（BALF）样本，按年龄、吸烟状态和抗逆转录病毒治疗与无阻塞性肺疾病的 HIV 感染者进行匹配。使用基于 SomaScan 适配体的检测方法测量了 6,414 种蛋白质。我们使用稀疏距离加权判别分析（sDWD）检验蛋白质表达的差异，并使用置换检验识别蛋白质与第一秒用力呼气容积占预计值百分比（FEV1pp）之间的单变量关联。显著的蛋白质被纳入通路过表达分析（ORA）。我们还构建了蛋白质驱动的
【主题与分类】
主题标签：COPD、Metabolomics、HIV、Proteomics。本站分类：呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0757f5fc81fefdf5d9125554134443b134f9bed621c0042202f45faec8e8cfd7
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- OpenDataLab:
数据说明
(2022). Lung proteome and metabolome endotype in HIV-associated obstructive lung disease [Dataset]. http://doi.org/10.5061/dryad.tmpg4f52x
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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