2021年呼吸道病毒感染流行病学与临床特征数据

该数据集来自tandf.figshare.com,包含2021年实验室确诊呼吸道病毒感染患者的分子诊断结果与临床流行病学数据,共337例患者/样本,涉及SARS-CoV-2(Gamma变异株)、流感B型、呼吸道合胞病毒(RSV)、人鼻病毒(HRV)及阴性病例

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2026-03-20 更新
浏览 8
基因组分类Respiratory tract infectionspublic health surveillanceSARS-CoV-2COVID-19 pandemicclinical profileCOVID-19
Data from: Epidemiological and clinical profile of respiratory viral infections in 2021: integrated surveillance during the COVID-19 pandemic

基本信息

模态
基因组
大小
0.000095544 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-03-20
版本
v2

资源简介

2021年呼吸道病毒感染流行病学与临床特征数据

Epidemiological and clinical profile of respiratory viral infections in 2021: integrated surveillance during the COVID-19 pandemic

该数据集来自tandf.figshare.com,包含2021年实验室确诊呼吸道病毒感染患者的分子诊断结果与临床流行病学数据,共337例患者/样本,涉及SARS-CoV-2(Gamma变异株)、流感B型、呼吸道合胞病毒(RSV)、人鼻病毒(HRV)及阴性病例。数据可用于描述感染流行病学与住院特征、比较不同病毒变异株的临床差异,并支持风险因素逻辑回归分析与症状聚类主成分分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Epidemiological and clinical profile of respiratory viral infections in 2021: integrated surveillance during the COVID-19 pandemic》发表于 Future Virology(2026),DOI:10.1080/17460794.2026.2624957。项目资助方:This study was supported by funding from Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais [APQ-00390-20], Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, and the Universidade Federal de Juiz de Fora. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.。源站首次发布:2026-03-20。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):COVID-19大流行打乱了其他呼吸道病毒的季节性和检测模式,使多个地区(包括巴西)的综合征监测和临床管理变得复杂。旨在描述2021年实验室确诊呼吸道病毒感染患者的流行病学、临床和住院特征,比较SARS-CoV-2变异株、流感B型、呼吸道合胞病毒(RSV)、人鼻病毒(HRV)和阴性病例。我们对337例患者/样本的分子诊断结果和临床-流行病学数据进行了回顾性分析。分析包括用于估计风险因素比值比(ORs)的逻辑回归和用于探索症状聚类的主成分分析(PCA)。SARS-CoV-2(Gamma变异株)、HRV、RSV和流感B型是最常检测到的病毒。PCA揭示了病毒特异性症状聚类。

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 95.54 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.31314758.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Microbiology、Genetics、Biotechnology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Cancer。主题标签:Respiratory tract infections、public health surveillance、SARS-CoV-2、COVID-19 pandemic、clinical profile。本站分类:呼吸系统疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology、Genetics、Biotechnology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Cancer。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epidemiological_and_clinical_profile_of_respiratory_viral_infections_in_2021_integrated_surveillance_during_the_COVID-19_pandemic/31314758

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Epidemiological and clinical profile of respiratory viral infections in 2021: integrated surveillance during the COVID-19 pandemic. Taylor & Francis. Ozanic, Katia; Watanabe, Aripuanã Sakurada Aranha; da Costa, Antonio Charlys; Freitas, Vanessa Galdeno; Maria Carvalho, Eva de Assis de; Dias, Vanessa…

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curl -L -o "Table 6.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/61802042"

文件清单

  • Table 3.docx(28.25 KB)
  • Table 4.docx(27.08 KB)
  • Table 5.docx(13.26 KB)
  • Table 6.docx(26.95 KB)

文件总体积 95.54 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

COVID-19大流行打乱了其他呼吸道病毒的季节性和检测模式,使包括巴西在内的多个地区的综合征监测和临床管理变得复杂。旨在描述2021年实验室确诊呼吸道病毒感染患者的流行病学、临床和住院特征,并比较SARS-CoV-2变异株、乙型流感、呼吸道合胞病毒(RSV)、人鼻病毒(HRV)及阴性病例。我们对337例患者/样本的分子诊断结果和临床-流行病学数据进行了回顾性分析。分析包括逻辑回归以估计风险因素的比值比(OR),以及主成分分析(PCA)以探索症状聚类。SARS-CoV-2(Gamma变异株)、HRV、RSV和乙型流感是检出最多的病毒。PCA揭示了病毒特异性症状聚类,但病原体之间存在显著重叠。与Delta相比,Gamma显示出更高的临床严重程度(OR约3.0;95%CI:1.21–7.32)。糖尿病和肥胖与COVID-19显著相关。合并感染不常见,且与更高的严重程度无关。

研究结果支持在哨点环境中采用多重PCR进行综合性呼吸道监测,开展变异株敏感的临床筛查和及时的基因组特征分析,以指导诊疗路径并为当地公共卫生行动提供依据。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.31314758.v2(source: https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epidemiological_and_clinical_profile_of_respiratory_viral_infections_in_2021_integrated_surveillance_during_the_COVID-19_pandemic/31314758)。

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