基于光纤光谱比值内窥显微术增强细菌成像与肺自发荧光对比度的数据与代码

数据集获取

源站：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/3271

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

基于光纤的光学内窥显微术（OEM）可在内镜可及的组织中实现高分辨率荧光显微成像。光纤式OEM有潜力可视化由荧光成像探针靶向的病变，并提供一种体内原位分子病理学平台，以增进对疾病的理解、诊断和分层。在此，我们提出一种廉价的宽场比率式光纤OEM系统，能够增强病理相关荧光信号中相似光谱之间的对比度，而无需承担复杂光谱解混的负担。作为一个示例，我们展示了该平台在完整离体人肺中高自发荧光肺组织这一具有挑战性的环境中检测荧光标记革兰阴性菌的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。