COMMUNITY - COVID-19 免疫研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06784739

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：COVID-19、呼吸道合胞病毒、流感病毒、SARS-CoV-2病毒。COMMUNITY研究旨在纵向追踪医护人员和康复的COVID-19患者，以评估SARS-CoV-2免疫反应随时间的变化。随访每四个月进行一次，包括血清、PBMC和黏膜（唾液和鼻腔分泌物）样本。通过定期进行的附加采样和PCR筛查的子研究，评估疫苗反应及其与抗感染保护的相关性。分析内容包括：* 抗体反应的定量和特征描述 * T细胞和B细胞反应的评估 * RT-qPCR检测病毒感染 * 黏膜微生物组评估。每次随访时，通过基于智能手机的应用程序系统收集临床和人口统计学数据，包括医院工作场所、暴露情况、免疫抑制治疗或状况以及SARS-CoV-2快速诊断测试结果的信息。SARS-CoV-2感染和疫苗接种数据来自国家登记处。此外，持续监测家庭PCR筛查数据，以检测SARS-CoV-2、流感和RSV感染。

所有样本均保存在瑞典生物样本库（Biobank Sweden）中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。