CheXmask-U:胸部X线图像中基于关键点的解剖分割掩膜不确定性估计

CheXmask-U 提供从地标点衍生的胸部X光片解剖分割掩膜,并带有逐节点不确定性估计,从而支持地标级和图像级分析,用于不确定性感知研究与鲁棒性评估

physionet
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医学影像图像分割胸部X线医学影像呼吸系统解剖分割不确定性估计地标检测鲁棒性评估图像分析
CheXmask-U: Uncertainty Estimation for Landmark-Based Anatomical Segmentation Masks in Chest X-ray Images

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-01
版本
1.0.0

资源简介

CheXmask-U:胸部X线图像中基于关键点的解剖分割掩膜不确定性估计

CheXmask-U 提供从地标点衍生的胸部X光片解剖分割掩膜,并带有逐节点不确定性估计,从而支持地标级和图像级分析,用于不确定性感知研究与鲁棒性评估

chexmask-u

【数据集背景】

本数据集源站标题为《CheXmask-U: Uncertainty Estimation for Landmark-Based Anatomical Segmentation Masks in Chest X-ray Images》。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):CheXmask-U 提供从地标点衍生的胸部X光片解剖分割掩膜,并带有逐节点不确定性估计,从而支持地标级和图像级分析,用于不确定性感知研究与鲁棒性评估。

【主题与分类】

主题标签:胸部X线、医学影像、呼吸系统、解剖分割、不确定性估计、地标检测、鲁棒性评估、图像分析。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://physionet.org/content/chexmask-u/

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使用方式

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  1. 在 https://physionet.org/content/chexmask-u/1.0.0 页面登录并接受许可条款;
  2. 命令行整目录下载:
wget -r -N -c -np --user=<账号> --ask-password https://physionet.org/files/chexmask-u/1.0.0/
  1. 或用官方工具(推荐,支持断点续传与校验):
pip install physionet-download
physionet-download chexmask-u

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

我们提出了 CheXmask 数据集的扩展版本,通过逐节点不确定性估计增强了胸部 X 线片的原始解剖分割掩膜。该数据集保留了对五个公共来源——ChestX-ray8、CheXpert、MIMIC-CXR-JPG、Padchest 和 VinDr-CXR——的全面覆盖,同时为每个解剖标志点提供了不确定性估计。CheXmask-U 支持标志点级和图像级不确定性评估,可服务于医学影像中的不确定性感知分割研究、鲁棒性评估、校准分析和分布外检测。该数据集包括左肺、右肺和心脏的经预处理、基于标志点的分割掩膜及其对应的逐节点不确定性估计,还包括基于反向分类准确率(RCA)的每个掩膜的原始独立质量控制评分。所获得的不确定性估计通过人工标志点标注、合成扰动实验和分布外分析进行了评估,表明不确定性与预测可靠性之间存在有意义的关系。

许可

Creative Commons Attribution 4.0 International Public Li

引用

学术使用请引用:Cosarinsky et al. (2026). CheXmask-U: Uncertainty Estimation for Landmark-Based Anatomical Segmentation Masks in Chest X-ray Images. PhysioNet. doi:10.13026/6vn3-3j51 DOI 10.13026/6vn3-3j51。

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