两例铍暴露受试者支气管肺泡灌洗样本特征分析

该数据集来源于omicsdi.org,包含两例铍暴露受试者的支气管肺泡灌洗(BAL)样本,其中一例为铍暴露(BeS)受试者,另一例为慢性铍病(CBD)患者

omicsdi
浏览 4
基因组分类Transcriptomics
Characterization of bronchoalveolar lavage samples from two Be-exposed subjects

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

两例铍暴露受试者支气管肺泡灌洗样本特征分析

该数据集英文名为“Characterization of bronchoalveolar lavage samples from two Be-exposed subjects”,来源于omicsdi.org,主题标签为Transcriptomics,在分类上归入呼吸系统疾病/其他类别。数据集包含两例铍暴露受试者的支气管肺泡灌洗(BAL)样本,其中一例为铍暴露(BeS)受试者,另一例为慢性铍病(CBD)患者。慢性铍病是一种金属诱导的超敏性疾病,以CD4+ T细胞肺泡炎为特征。该数据集围绕BAL细胞中T细胞的单细胞基因表达谱展开,旨在为理解气道相关CD4+ T细胞的细胞组成、独特亚群及功能通路提供数据基础,并可能为慢性铍病及其他肉芽肿性肺疾病的新型治疗策略开发提供线索。

【数据集背景】

慢性铍病(CBD)是一种由金属铍暴露引发的超敏性疾病,其典型病理特征为CD4+ T细胞肺泡炎。对支气管肺泡灌洗(BAL)细胞中T细胞进行单细胞基因表达谱分析,有助于识别CD4+ T细胞的独特亚群、相关功能通路或分子,这些发现有可能进一步发展为治疗CBD及其他肉芽肿性肺疾病的新型治疗手段。该数据集正是围绕这一研究背景构建,聚焦于铍暴露受试者气道相关CD4+ T细胞的非偏倚细胞组成分析。

【数据内容】

该数据集的主题标签为Transcriptomics,核心数据为来自两例受试者支气管肺泡灌洗(BAL)样本的单细胞基因表达谱信息。两例样本分别来自一例铍暴露(BeS)受试者和一例慢性铍病(CBD)患者,二者共同构成该研究的疾病队列。数据关注的对象是BAL细胞中的T细胞,尤其是气道相关的CD4+ T细胞,用于刻画其细胞组成与转录组特征。除上述样本类型、受试者构成及转录组学主题外,源站未提供更细化的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。样本为支气管肺泡灌洗(BAL)细胞,取自两例铍暴露受试者:一例为铍暴露(BeS)受试者,另一例为慢性铍病(CBD)患者,后者的诊断依据为先前已定义的诊断标准。研究采用单细胞基因表达谱分析技术对BAL细胞中的T细胞进行表征。关于样本采集的具体时间、地点、机构及处理流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病特别是慢性铍病相关的基础研究场景,可用于探索铍暴露个体气道CD4+ T细胞的亚群构成、功能通路及潜在分子靶点,也可为CBD与其他肉芽肿性肺疾病的比较研究及治疗靶点发现提供转录组层面的参考。由于样本量仅为两例,其适用场景应限于探索性分析和方法验证,不宜直接用于人群层面的推断。源站未提供其他具体适用场景的说明。

【使用方法】

该数据集以单细胞基因表达谱数据为核心,使用者可围绕BAL细胞中T细胞的转录组特征开展细胞亚群识别、功能通路分析等探索性研究。使用时应注意区分铍暴露(BeS)与慢性铍病(CBD)两例样本的来源差异,并结合研究目的合理设计比较分析。关于数据的具体格式、下载方式、分析流程及软件工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含两例受试者样本,样本量很小,研究结论的统计效力与外推能力有限,属于探索性、描述性研究的数据基础。两例样本分别代表铍暴露与慢性铍病两种状态,缺乏更广泛的对照与重复样本。关于数据质量评估、测序深度、细胞数量及批次信息等,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE181174

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性铍病(CBD)是一种由金属诱发的超敏反应性疾病,以CD4+ T细胞肺泡炎为特征。对支气管肺泡灌洗(BAL)细胞进行聚焦于T细胞的单细胞基因表达谱分析,可能有助于揭示CD4+ T细胞的独特亚群、功能通路和/或分子,这些有望被开发为治疗CBD及其他肉芽肿性肺疾病的新型疗法。为理解铍暴露受试者气道相关CD4+ T细胞的无偏细胞组成,我们使用了来自一名铍暴露(BeS)受试者和一名依据既往既定标准诊断的CBD受试者的BAL细胞,这两份样本构成了疾病队列。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案