支气管扩张症基因-疾病关联数据集

数据围绕成人支气管扩张症患者的肺功能损害展开,涵盖基线胸部高分辨率 CT、痰液量、脓性与细菌学、肺量计与弥散功能,以及急性加重期和恢复期的肺量计随访

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2023-05-31 更新
浏览 1
医学影像分类chest HRCT abnormalityFEV 1bronchiectasifvcspirometric parametersconvalescencecultureLung Function ImpairmentcapacitysputumexacerbationFEV 1. Changes
Bronchiectasis — Gene-Disease Associations

基本信息

模态
医学影像
大小
0.002060288 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

支气管扩张症基因-疾病关联数据集

Characterization of Lung Function Impairment in Adults with Bronchiectasis

该数据集来自 plos.figshare.com,配套论文为 2014 年发表于 PLoS ONE 的《Characterization of Lung Function Impairment in Adults with Bronchiectasis》。数据围绕成人支气管扩张症患者的肺功能损害展开,涵盖基线胸部高分辨率 CT、痰液量、脓性与细菌学、肺量计与弥散功能,以及急性加重期和恢复期的肺量计随访。共纳入 142 例稳定期患者,其中 44 例急性加重者进入亚组分析。文件包含图、文档、检查清单和方案等 4 个文件,可用于研究肺功能损害相关因素及加重期肺功能变化(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Characterization of Lung Function Impairment in Adults with Bronchiectasis》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0113373。源站首次发布:2014-11-18。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景 支气管扩张症中肺功能损害的临床特征尚未被充分认识。目的 确定与肺功能损害相关的因素,并比较支气管扩张症急性加重期与恢复期(14 天抗生素治疗后 1 周)肺量计检查的变化。方法 我们招募了 142 例稳定期支气管扩张症患者,其中随访期间出现急性加重的 44 例被纳入亚组分析。基线测量包括胸部高分辨率计算机断层扫描(HRCT)、痰液量、脓性和细菌学、肺量计检查和弥散功能。在急性加重期和恢复期检查肺量计检查,但不检查弥散功能。结果 在最终多变量模型中,支气管扩张症症状持续 10 年或以上(OR = 4.75,95%CI:1.46–15.43,P = 0.01)、痰培养铜绿假单胞菌阳性(原文此处截断)

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 2.06 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0113373。

【主题与分类】

源站学科分类:Uncategorised。主题标签:chest HRCT abnormality、FEV 1、bronchiectasi、fvc、spirometric parameters、convalescence、culture、Lung Function Impairment、capacity、sputum。本站分类:呼吸系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Uncategorised。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Characterization_of_Lung_Function_Impairment_in_Adults_with_Bronchiectasis_/1245684

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Guan, Wei-jie; Gao, Yong-hua; Xu, Gang; Lin, Zhi-ya; Tang, Yan; Li, Hui-min; et al. (2016). Characterization of Lung Function Impairment in Adults with Bronchiectasis. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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命令行下载

curl -L -o "Figure_S1.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/1799214"
curl -L -o "File_S1.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/1799215"
curl -L -o "Checklist_S1.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1799216"
curl -L -o "Protocol_S1.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/1799217"

文件清单

  • Figure_S1.tif(1.74 MB)
  • File_S1.doc(194.56 KB)
  • Checklist_S1.docx(19.02 KB)
  • Protocol_S1.doc(111.10 KB)

文件总体积 2.06 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景
支气管扩张症肺功能损害的特征尚未完全明确。目的
确定与肺功能损害相关的因素,并比较支气管扩张症急性加重期与恢复期(14天抗生素治疗后1周)肺量计检查的变化。方法
我们招募了142例稳定期支气管扩张症患者,其中随访期间出现急性加重的44例被纳入亚组分析。基线测量包括胸部高分辨率计算机断层扫描(HRCT)、痰量、脓性及细菌学、肺量计检查和弥散功能。在急性加重期和恢复期检查肺量计,但不检查弥散功能。结果
在最终多因素模型中,支气管扩张症状持续10年或以上(OR=4.75,95%CI:1.46–15.43,P=0.01)、痰培养铜绿假单胞菌阳性(OR=4.93,95%CI:1.52–15.94,PP1为50%pred或以下;与DLCO降低相关的唯一变量是支气管扩张累及4个或以上肺叶(OR=5.91,95%CI:2.20–17.23,P1在急性加重期和恢复期具有显著性(P1和基线时DLCO降低。

结论
在以轻至中度稳定期支气管扩张为主的患者中,显著的肺功能损害应警惕胸部高分辨率CT(HRCT)异常及痰培养铜绿假单胞菌阳性。急性加重可引起FVC和FEV1下降。急性加重期间其他肺功能参数的变化较不显著。试验注册
ClinicalTrials.gov NCT01761214

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0113373(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Characterization_of_Lung_Function_Impairment_in_Adults_with_Bronchiectasis_/1245684)。

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