生物制剂重定位：ml-SOM 分析原始结果

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.3458791

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

摘要 本数据集包含英夫利昔单抗和布罗达鲁单抗多层SOM（ml-SOM）重定位分析的原始结果文件。Infliximab_results.zip归档文件包含英夫利昔单抗（T1）作为溃疡性结肠炎（D1）、克罗恩病（D2）、COPD（R1）和结节病（R2）潜在治疗药物的ml-SOM重定位分析结果。归档文件中数据组织如下：inflixmab_UC_CD_COPD_SARC021018_results+.RData - 包含ml-SOM环境的R数据文件，文件夹“inflixmab_UC_CD_COPD_SARC021018_results+ - Results” - 包含代表ml-SOM分析结果的各种PDF和CSV文件。它还包含所有数据集的独立层级SOM分析结果：文件夹“1” - 英夫利昔单抗数据集的SOM分析，文件夹“2” - 溃疡性结肠炎和克罗恩病数据集的SOM分析，文件夹“3” - COPD数据集的SOM分析，文件夹“4” - 结节病数据集的SOM分析。Brodalumab_results.zip归档文件包含布罗达鲁单抗（T1）作为银屑病（D1）、克罗恩病（R1）和全身性幼年特发性关节炎（R2）潜在治疗药物的ml-SOM重定位分析结果。

数据在存档中按如下方式组织：brodalumab_CD_SJIA_301218_results+.RData - 包含ml-SOM环境文件夹“brodalumab_CD_SJIA_301218_results+ - Results”的R数据文件 - 由代表ml-SOM分析结果的各种PDF和CSV文件组成。它还包含所有数据集的独立层级SOM分析结果：文件夹“1” - brodalumab和银屑病数据集的SOM分析 文件夹“2” - 克罗恩病数据集的SOM分析 文件夹“3” - 全身型幼年特发性关节炎数据集的SOM分析 有关浏览结果及其解释的详细说明，请参阅oposSOM包手册[1]，以及原始出版物[2-4]。参考文献 Henry Loeffler-Wirth, Hoang Thanh Le and Martin KalcheroposSOM.转录组数据的综合分析。DOI: 10.18129/B9.

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。