Milieu Intérieur 队列中基于 Luminex 的 80 种常见病原体抗体水平数据

使用基于微球的 Luminex Intelliflex 系统定量检测针对 80 种抗原的抗体水平。抗原来源于常见呼吸道病原体及引起常规疫苗可预防疾病的病原体的广泛组合

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其他回归疫苗编码
Antibody levels against 80 antigens from common pathogens by Luminex in the Milieu Intérieur cohort

基本信息

模态
其他
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-01
版本
1.0

资源简介

Milieu Intérieur 队列中基于 Luminex 的 80 种常见病原体抗体水平数据

该数据集名为“Antibody levels against 80 antigens from common pathogens by Luminex in the Milieu Intérieur cohort”,收录了针对80种抗原的抗体水平定量检测结果。检测采用基于微球的Luminex Intelliflex系统完成,所用抗原来自常见呼吸道病原体以及引起常规疫苗可预防疾病的病原体的广泛组合。抗体滴度在Milieu Intérieur队列的两次访视中测定:第一次访视覆盖1000名个体,第三次访视覆盖414名个体,两次访视相隔10年。数据收集的目的在于评估Milieu Intérieur参与者对最常见病原体的感染史,并确定既往感染所起的作用。该数据集在站内归入呼吸系统疾病/其他分类,来源站为doi.org,作者为Etienne Patin、Darragh Duffy和Michael White,机构为OWEY,发布时间为2026年。

【数据集背景】

该数据集服务于对人群感染史的免疫学评估。源站描述指出,数据收集的目标是评估Milieu Intérieur参与者针对最 prevalent 病原体的感染历史,并确定既往感染如何发挥作用。检测覆盖的抗原既包括常见呼吸道病原体来源,也包括引起常规疫苗可预防疾病的病原体来源,因此可用于从体液免疫角度回顾性刻画个体与人群的病原体暴露背景。Milieu Intérieur队列在相隔10年的两次访视中重复测量抗体滴度,为观察抗体水平的长期状态提供了同一队列内的两时点材料。

【数据内容】

数据集的核心内容是针对80种抗原的抗体水平测量值,采用基于微球的Luminex Intelliflex系统进行定量。每次访视提供两个.tsv文件:一个文件描述所收集的抗原变量,另一个文件包含测量结果。描述文件中,抗原变量按行组织,列包括变量名、描述和 cutoff 值;测量文件中,参与者按行组织,抗原变量按列组织。第一次访视对应1000名个体,第三次访视对应414名个体,两次访视相隔10年。抗原来源覆盖常见呼吸道病原体及引起常规疫苗可预防疾病的病原体的广泛组合。

【采集与来源】

数据来源于Milieu Intérieur队列的第一次访视与第三次访视。抗体滴度使用Luminex Intelliflex系统测定,该系统为基于微球的检测平台。源站描述说明,抗原来自常见呼吸道病原体与常规疫苗可预防疾病病原体的广泛组合。数据集来源站为doi.org,作者为Etienne Patin、Darragh Duffy和Michael White,机构为OWEY,发布时间为2026年。站内分类为呼吸系统疾病/其他。

【适用场景】

依据数据收集目的,该数据集适用于评估Milieu Intérieur参与者对最常见病原体的感染史,以及考察既往感染在其中的作用。由于抗原组合同时涵盖常见呼吸道病原体与常规疫苗可预防疾病的病原体,抗体水平测量可用于围绕这两类病原体暴露背景的免疫学分析。两次访视相隔10年、分别覆盖1000名和414名个体,使同一队列内的两时点抗体水平比较成为可能。具体分析设计与应用范围源站未提供。

【使用方法】

使用时需结合每次访视的两个.tsv文件:描述文件提供抗原变量的变量名、描述与cutoff值,测量文件提供参与者层面的抗体测量值,参与者为行、抗原变量为列。两文件通过抗原变量对应关联。cutoff值可用于界定抗体水平的判定阈值。两次访视的数据分别组织,可分别读取或按参与者对齐后比较。更详细的使用说明源站未提供。

【质量与限制】

源站描述提供了每次访视的文件结构、样本量与检测平台信息,但未提供检测重复性、批间一致性、缺失值处理或数据质控指标等质量信息。第三次访视样本量为414名个体,小于第一次访视的1000名个体,两时点样本规模不一致。抗体水平反映体液免疫状态,其解释受感染史、疫苗接种史与采样时点等因素影响,源站未就这些因素提供进一步说明。其他限制源站未提供。

【引用与许可】

作者为Etienne Patin、Darragh Duffy和Michael White,机构为OWEY,发布时间为2026年,来源站为doi.org。许可条款与具体引用格式源站未提供。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

使用基于微球的Luminex Intelliflex系统对针对80种抗原的抗体水平进行了定量。这些抗原来源于一组广泛的常见呼吸道病原体以及引起常规疫苗可预防疾病的病原体。在Milieu Intérieur队列的第1次访视(1000人)和第3次访视(414人,10年后)中测量了抗体滴度。每次访视有两个文件可用:一个.tsv文件描述所收集的抗原变量,另一个.tsv文件包含测量数据。文件结构如下:- 描述文件:抗原变量按行排列,列包括变量名、描述和 cutoff 值;- 测量文件:参与者按行排列,抗原变量按列排列。收集这些数据是为了评估Milieu Intérieur参与者对最常见病原体的感染史,并确定既往感染如何导致免疫反应的个体间差异。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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