新冠疫苗降解数据集

包含新冠疫苗蛋白质序列及降解率标签的数据集,用于回归预测疫苗降解。

Gleghorn LabGleghorn Lab
HuggingFace
2024-08-09 更新
浏览 57
蛋白质size_categories:1K<n<10Kformat:parquetmodality:textlibrary:datasetslibrary:pandaslibrary:mlcroissantlibrary:polarsregion:us疫苗编码
cov_vaccine_degradation

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000454482 GB
数据量
5
创建/更新时间
2024-08-09

资源简介

新冠疫苗降解数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《GleghornLab/cov_vaccine_degradation》。源站首次发布:2024-08-09。

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 183.34 KB。

【主题与分类】

主题标签:size_categories:1K<n<10K、format:parquet、modality:text、library:datasets、library:pandas、library:mlcroissant、library:polars、region:us。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://huggingface.co/datasets/GleghornLab/cov_vaccine_degradation

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-08-13,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("GleghornLab/cov_vaccine_degradation")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install &amp;&amp; git clone https://hf-mirror.com/datasets/GleghornLab/cov_vaccine_degradation

数据说明

该数据集包含新冠病毒疫苗相关的蛋白质序列(seqs)及其对应的降解标签(labels),用于预测疫苗降解率。数据分为训练集、验证集和测试集,属于回归任务,旨在研究疫苗稳定性。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

完整数据卡:huggingface.co/datasets/GleghornLab/cov_vaccine_degradation

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