特发性肺纤维化上皮细胞转录组分析补充文件1
该数据为特发性肺纤维化（IPF）上皮细胞转录组研究的补充文件1，包含Supplementary Table 1的差异表达基因列表
基本信息
资源简介
特发性肺纤维化上皮细胞转录组分析补充文件1
Additional file 1 of Transcriptomic profiling reveals disease-specific characteristics of epithelial cells in idiopathic pulmonary fibrosis
该数据为特发性肺纤维化（IPF）上皮细胞转录组研究的补充文件1，包含Supplementary Table 1的差异表达基因列表。数据来自IPF与非IPF患者MSC样细胞来源的上皮细胞（EC）比较，共199个差异表达基因，其中IPF-ECs中80个上调、119个下调。文件为Excel格式，可用于筛选IPF相关上皮细胞差异基因、支持呼吸系统疾病转录组分析及生物标志物探索（来源 figshare，CC BY + CC0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Targeted Injury of Type II Alveolar Epithelial Cells Induces Pulmonary Fibrosis》发表于 American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine（2010），DOI：10.1164/rccm.200810-1615OC。项目资助方：Schweizerischer Nationalfonds SNF SGP/Lungenliga。源站首次发布：2020-07-01。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：补充文件1：补充表1。差异表达基因列表。在IPF与非IPF患者来源的MSC样细胞衍生EC中，共有199个基因差异表达，其中IPF-ECs中80个基因上调、119个基因下调。使用的缩写：CPM，counts per million（比对上的reads）；EC，上皮细胞；FC，倍数变化；FDR，错误发现率；IPF，特发性肺纤维化；MSC，间充质干细胞。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 27.32 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.12592631.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。主题标签：Idiopathic pulmonary fibrosis、Lung fibrosis、Epithelial cell、Mesenchymal stem cell、RNA-sequencing。本站分类：呼吸系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。
【获取与许可】
源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_of_Transcriptomic_profiling_reveals_disease-specific_characteristics_of_epithelial_cells_in_idiopathic_pulmonary_fibrosis/12592631
使用许可：CC BY + CC0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Boesch, Maximilian; Baty, Florent; Brutsche, Martin H.; Tamm, Michael; Roux, Julien; Knudsen, Lars; et al. (2020). Additional file 1 of Transcriptomic profiling reveals disease-specific characteristics of epithelial cells in idiopathic pulmonary fibrosis. figshare. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Additional file 1 of Transcriptomic profiling reveals disease-specific characteristics of epithelial cells in idiopathic pulmonary fibrosis
- DOI：10.6084/m9.figshare.12592631.v1
- 发布日期：2020-07-01
- 文件数：1 个
- 文件总体积：27.32 KB
- 源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_of_Transcriptomic_profiling_reveals_disease-specific_characteristics_of_epithelial_cells_in_idiopathic_pulmonary_fibrosis/12592631
命令行下载
curl -L -o "12931_2020_1414_MOESM1_ESM.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/23574494"
文件清单
12931_2020_1414_MOESM1_ESM.xlsx（27.32 KB）
文件总体积 27.32 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
附加文件1：补充表1。差异表达基因列表。来自IPF患者与非IPF患者的MSC样细胞衍生内皮细胞中，共有199个基因存在差异表达，其中IPF-ECs中有80个基因上调，119个基因下调。所用缩写：CPM，每百万计数（比对上的读数）；EC，上皮细胞；FC，倍数变化；FDR，错误发现率；IPF，特发性肺纤维化；MSC，间充质干细胞。
许可
CC BY + CC0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.12592631.v1（source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_of_Transcriptomic_profiling_reveals_disease-specific_characteristics_of_epithelial_cells_in_idiopathic_pulmonary_fibrosis/12592631）。
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