康复期COVID-19患者血清细胞因子与代谢组的绝对定量及glycylproline调控抗体衰减研究

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS3305

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数据说明

COVID-19大流行在全球范围内造成了巨大损失，并在“新常态”下仍威胁着公众健康。康复期COVID-19患者中和抗体水平与代谢改变之间的关联仍知之甚少。在本研究中，我们进行了绝对定量分析，以比较具有抗体的普通康复患者（CA）、抗体快速消退的康复者（CO）以及健康受试者的血浆细胞因子和代谢组。结果，我们发现M-CSF和IL-12p40等细胞因子以及甘氨酰脯氨酸（gly-pro）和长链酰基肉碱等血浆代谢物可能与COVID-19康复患者中的抗体消退相关。经过特征选择，我们使用17个特征（6种细胞因子和11种代谢物）构建了基于机器学习的分类模型。至少在6个机器学习模型中达到了超过90%的总体准确率。值得注意的是，与CA组相比，二肽gly-pro——由二肽基肽酶4（DPP4）催化的酶促肽裂解产物——在CO个体中强烈积累。

此外，在健康小鼠中进行的严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）疫苗接种实验表明，补充甘氨酰-脯氨酸（gly-pro）会下调SARS-CoV-2特异性受体结合域抗体水平并抑制免疫应答，而DPP4抑制剂西格列汀则可抵消gly-pro对SARS-CoV-2疫苗接种的抑制作用。我们的研究不仅揭示了gly-pro在SARS-CoV-2感染免疫应答中的重要作用，还提示了DPP4抑制剂治疗对COVID-19恢复期患者产生有益结局的可能机制，为针对COVID-19的治疗和疫苗接种策略提供了新思路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。