COPD外周免疫细胞单细胞与流式数据样本集

该数据集来自omicsdi.org,属于呼吸系统疾病分类,主题标签为Genomics。源站描述显示,研究结合多色流式细胞术与单细胞RNA测序,分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周免疫细胞的分子变化,发现血液中性粒细胞数量显著增加且具有异质性,其中表达干扰素反应基因的转录状态与肺泡损伤和急性加重相

omicsdi
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基因组分类Genomics
基因组a2ed41ad-9e33-4b5f-a017-174c07f91042 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

COPD外周免疫细胞单细胞与流式数据样本集

该数据集来自omicsdi.org,属于呼吸系统疾病分类,主题标签为Genomics。源站描述显示,研究结合多色流式细胞术与单细胞RNA测序,分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周免疫细胞的分子变化,发现血液中性粒细胞数量显著增加且具有异质性,其中表达干扰素反应基因的转录状态与肺泡损伤和急性加重相关,支气管肺泡中性粒细胞表达与部分血液中性粒细胞状态对应的基因特征,并在香烟烟雾暴露小鼠模型中观察到骨髓中性粒细胞祖细胞扩增。数据可用于COPD免疫细胞异质性及中性粒细胞状态相关研究(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性阻塞性肺疾病(COPD)是一种主要呼吸系统疾病,以小气道炎症、肺气肿和严重呼吸困难为特征。低度全身性炎症是重症疾病的既定标志,然而外周免疫细胞中的分子变化仍远未被了解。我们结合多色流式细胞术与单细胞RNA测序,显示COPD中血液中性粒细胞数量显著增加,且它们是一个异质性群体。一个表达干扰素反应基因的转录组状态与肺泡损伤和急性加重相关。此外,支气管肺泡中性粒细胞表达与某些血液中性粒细胞状态相对应的基因特征。最后,我们在香烟烟雾暴露小鼠模型中的数据表明,烟雾处理下骨髓中性粒细胞祖细胞发生扩增

【主题与分类】

主题标签:Genomics。本站分类:呼吸系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008908

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008908

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性阻塞性肺疾病(COPD)是一种以细支气管炎症、肺气肿和严重呼吸困难为特征的主要呼吸系统疾病。低度全身性炎症是重症疾病的既定标志,然而,外周免疫细胞中的分子变化仍远未被充分理解。我们结合多色流式细胞术与单细胞RNA测序,发现COPD患者血液中性粒细胞数量显著增加,且呈现异质性群体。一种表达干扰素反应基因的转录组状态与肺泡损伤和急性加重相关。此外,支气管肺泡中性粒细胞表达与某些血液中性粒细胞状态相对应的基因特征。最后,我们在香烟烟雾暴露的小鼠模型中的数据表明,烟雾处理动物的骨髓中性粒细胞祖细胞扩增,并显示出免疫激活的迹象。我们的研究提供证据表明,COPD全身性炎症可能源于激活的造血前体细胞区室。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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