SARS-CoV-2与人类蛋白互作图谱揭示药物靶点及潜在药物再利用
该数据集源自omicsdi.org，主题为Proteomics，对应一项利用亲和纯化质谱全局解析SARS-CoV-2与人类宿主蛋白物理互作的研究，覆盖26种病毒蛋白的宿主互作谱
基本信息
资源简介
SARS-CoV-2与人类蛋白互作图谱揭示药物靶点及潜在药物再利用
该数据集英文名为“A SARS-CoV-2-Human Protein-Protein Interaction Map Reveals Drug Targets and Potential Drug-Purposing”，来源于omicsdi.org，主题标签为Proteomics，本站归类于呼吸系统疾病/其他。它对应一项利用亲和纯化质谱全局解析SARS-CoV-2与人类宿主蛋白物理互作的研究，覆盖26种病毒蛋白的宿主互作谱。该数据集旨在揭示SARS-CoV-2感染人细胞的分子机制，为识别药物靶点及潜在药物再利用提供蛋白质相互作用层面的数据基础，属于病毒—宿主蛋白互作图谱类资源。
【数据集背景】
SARS-CoV-2是COVID-19呼吸道疾病的病原体。自2019年底以来，该病毒引发的疫情已感染超过170,000人，造成超过7,400人死亡，并导致全球社会与经济秩序受到冲击。在确诊病例中，SARS-CoV-2感染的死亡率为3.4%，而当时尚无有效的抗病毒分子或疫苗可用于治疗或预防。寻找有效抗病毒疗法的努力近来开始重视宿主导向策略，但除描述病毒与细胞表面受体及激活蛋白酶相互作用的数据外，科学界对SARS-CoV-2感染的分子细节知之甚少。为阐明SARS-CoV-2感染人细胞的机制，研究采用亲和纯化质谱对病毒蛋白与宿主蛋白的物理互作进行了全局分析。
【数据内容】
该数据集的核心内容是SARS-CoV-2病毒蛋白与人类宿主蛋白之间的物理相互作用图谱，覆盖26种病毒蛋白的宿主互作谱。其主题标签为Proteomics，表明数据属于蛋白质组学范畴。数据集名称同时指向两类应用方向：揭示药物靶点以及潜在药物再利用。除上述范围性描述外，关于互作条目数量、涉及宿主蛋白的具体数目、实验重复次数、评分体系或注释字段等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org。研究采用的技术路线为亲和纯化质谱，用于全局分析病毒蛋白与宿主蛋白的物理互作。研究对象为SARS-CoV-2的26种病毒蛋白。关于样本类型、细胞系来源、质谱平台型号、实验批次及原始数据存放位置等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于病毒—宿主蛋白互作研究，可用于从宿主导向角度探索抗病毒干预策略，支持药物靶点识别与潜在药物再利用方向的筛选与分析。鉴于其主题为蛋白质组学且聚焦SARS-CoV-2感染人细胞的分子机制，也可作为呼吸道病毒致病机制研究的参考数据。关于具体分析流程、推荐工具或已验证的下游应用案例，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、覆盖度完整性、假阳性控制或验证实验的系统说明。需注意的是，该数据集描述的是物理互作谱，其结论范围受所研究的26种病毒蛋白及所用亲和纯化质谱方法所界定；除此之外的质量指标与限制说明，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000085144
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
由新型冠状病毒SARS-CoV-2（COVID-19呼吸道疾病的致病因子）引发的疫情自2019年底以来已感染超过17万人，导致逾7400人死亡，并造成全球范围内的社会与经济动荡。在确诊病例中，SARS-CoV-2感染的死亡率为3.4%，目前尚无有效的抗病毒分子或疫苗用于其治疗或预防。近期，寻找有效抗病毒疗法的研究突出了宿主导向策略，然而，除了描述病毒与细胞表面受体及激活蛋白酶相互作用的数据外，科学界对SARS-CoV-2感染的分子细节知之甚少。为了揭示SARS-CoV-2感染人类细胞的机制，我们运用亲和纯化质谱技术，对SARS-CoV-2基因组编码的26种病毒蛋白与宿主蛋白的物理相互作用进行了全面分析，鉴定出332个高置信度相互作用。在人类蛋白质中，我们识别了许多现有FDA批准药物可靶向的可成药人类蛋白，目前正在活体SARS-CoV-2感染实验中评估这些药物的有效性。
鉴定介导病毒感染的宿主依赖性因子，可能为开发针对SARS-CoV-2及其他致命冠状病毒株的广谱抗病毒靶点提供关键见解，有助于确定有效的分子靶标。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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