PRJNA1542835：维生素D缺乏与肺炎患儿系统性免疫重塑相关
该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov，包含肺炎患儿外周血单个核细胞的单细胞RNA测序和免疫组库测序数据，覆盖维生素D缺乏（P_VDD）、维生素D充足（P_VDS）的肺炎患儿以及健康对照（HC）
基本信息
资源简介
PRJNA1542835：维生素D缺乏与肺炎患儿系统性免疫重塑相关
PRJNA1542835 数据集聚焦于儿童肺炎与维生素 D 营养状态之间的免疫学关联，来源于 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集通过单细胞 RNA 测序和免疫组库测序技术，对肺炎患儿及健康儿童的外周血单个核细胞进行了系统分析。研究对象涵盖维生素 D 缺乏的肺炎患儿（P_VDD）、维生素 D 充足的肺炎患儿（P_VDS）以及健康对照（HC）三组人群。数据集旨在刻画不同维生素 D 状态下儿童肺炎的细胞组成、转录谱特征以及 T 细胞和 B 细胞受体组库特征，为理解维生素 D 状态与儿童肺炎系统性免疫重塑之间的关系提供原始测序数据基础。数据集主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），属于呼吸系统疾病中肺炎方向的数据资源。
【数据集背景】
维生素 D 缺乏在儿童群体中较为常见，而肺炎是儿童期重要的呼吸系统感染性疾病。维生素 D 不仅参与钙磷代谢，还具有免疫调节功能，其状态可能影响机体对感染的免疫应答。该数据集正是围绕“维生素 D 缺乏与儿童肺炎系统性免疫重塑相关”这一科学问题而生成，试图从单细胞分辨率和免疫组库层面揭示不同维生素 D 营养状态下肺炎患儿的免疫系统特征差异。数据集将肺炎患儿按维生素 D 缺乏与充足进行分组，并设置健康对照，为比较分析提供了三组平行设计。
【数据内容】
该数据集包含两类测序数据：单细胞 RNA 测序数据和免疫组库测序数据。样本来源为外周血单个核细胞。单细胞 RNA 测序用于表征细胞组成和转录谱特征，免疫组库测序用于刻画 T 细胞和 B 细胞受体组库特征。数据覆盖维生素 D 缺乏的肺炎患儿（P_VDD）、维生素 D 充足的肺炎患儿（P_VDS）以及健康对照（HC）三类研究对象。数据集的主题标签为原始序列读段，表明其提供的是测序产生的原始序列数据。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。生物样本为儿童外周血单个核细胞，取自肺炎患儿与健康对照。源站描述说明，这些测序数据是在维生素 D 缺乏与维生素 D 充足的肺炎患儿以及健康对照之间进行比较研究而生成的。关于具体的样本采集时间、采集地点、伦理审批信息及测序平台等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病尤其是儿童肺炎的免疫学研究场景。具体而言，可用于分析不同维生素 D 状态下肺炎患儿外周血单个核细胞的细胞组成差异、转录谱差异，以及 T 细胞和 B 细胞受体组库的多样性、克隆扩增和克隆型分布等特征。也可用于比较肺炎患儿与健康对照之间的免疫特征差异，探索维生素 D 状态与系统性免疫重塑之间的关联。此外，该数据可作为儿童肺炎免疫机制研究、生物标志物探索及后续验证研究的原始数据资源。
【使用方法】
该数据集以原始序列读段形式提供，使用者可根据单细胞 RNA 测序和免疫组库测序的常规分析流程进行处理。通常包括序列质量控制、比对或定量、细胞聚类与注释、差异表达分析，以及免疫组库的克隆型鉴定与多样性分析等步骤。使用时应按照研究分组（P_VDD、P_VDS、HC）进行分层比较。关于数据的具体下载方式、文件组织结构和配套分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为原始序列读段，未提供经过处理的表达矩阵或组库注释结果。源站未提供样本量、测序深度、测序平台、质控指标等具体技术参数，也未提供伦理审批和知情同意相关信息。数据集仅涵盖外周血单个核细胞，未涉及其他组织或临床表型的详细记录。使用者在解释结果时需考虑这些信息缺失带来的限制。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或使用该数据前，应访问 ncbi.nlm.nih.gov 上的对应记录以获取最新的引用要求和数据使用政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1542835
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
单细胞RNA测序和免疫组库测序数据来自维生素D缺乏肺炎患儿（P_VDD）、维生素D充足肺炎患儿（P_VDS）以及健康对照（HC）的外周血单个核细胞。该数据集旨在表征儿童肺炎中与维生素D状态相关的细胞组成、转录谱以及T细胞和B细胞受体库特征。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
