尼曼-匹克病成纤维细胞转录组数据集
该数据集包含尼曼-匹克病C型患者成纤维细胞的基因表达数据及对照样本信息，主要用于分析溶酶体脂质代谢异常、神经退行性机制以及疾病相关基因表达变化，适用于转录组分析与疾病机制研究。
基本信息
资源简介
尼曼-匹克病成纤维细胞转录组数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Modeling oncogenic signaling in colon tumors by multidirectional analyses of microarray data》。源站首次发布：Mar 16 201。
【数据内容】
源站原始描述：Background. Most colorectal cancers (CRC) arise in a progression through adenoma to carcinoma phenotypes as a consequence of altered genetic information. Clinical progression of CRC may occur in parallel with distinctive signaling alterations. We designed multidirectional analyses integrating microarray-based data with biostatistics and bioinformatics to elucidate the signaling and metabolic alterations underlying CRC development in the adenoma-carcinoma sequence. Methodology/Principal Findings.…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL570、9606。
【适用方向】
文本类数据可用于医学自然语言处理，如命名实体识别、信息抽取与文本分类。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE20916
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE20916
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来源于NCBI GEO，包含尼曼-匹克病C型患者来源的成纤维细胞基因表达谱数据，并与正常对照样本进行对比分析，用于研究溶酶体脂质代谢异常及相关分子机制。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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