非CF与CF样本的人支气管上皮制备单细胞RNA测序图谱
该数据集来自 omicsdi.org,收录了针对人支气管上皮制备开展的单细胞RNA测序数据,样本涵盖非囊性纤维化(non-CF)与囊性纤维化(CF)来源

基本信息
资源简介
非CF与CF样本的人支气管上皮制备单细胞RNA测序图谱
该数据集为一项针对人支气管上皮制备开展的单细胞RNA测序研究,样本涵盖非囊性纤维化(non-CF)与囊性纤维化(CF)两类来源,可用于在单细胞层面观察支气管上皮细胞在疾病背景及炎症因子刺激下的转录组特征。数据集英文名称为“Single-cell RNA-seq profiling of human bronchial epithelial preparations from non-CF and CF samples”,在站内归入呼吸道疾病/囊性纤维化分类,来源站为omicsdi.org,主题标签为Transcriptomics。整体而言,该数据集以转录组学为技术主线,围绕囊性纤维化相关气道上皮的细胞异质性提供测序数据资源,适合作为呼吸系统疾病单细胞研究的基础数据参考。
【数据集背景】
囊性纤维化是一种累及呼吸系统的疾病,气道支气管上皮细胞是其病理生理研究的重要对象。单细胞RNA测序能够在单个细胞分辨率上刻画上皮制备中的细胞组成与转录状态,为比较非囊性纤维化与囊性纤维化样本之间的差异提供数据基础。该数据集即在这一背景下产生,聚焦人支气管上皮制备,主题标签为Transcriptomics,站内分类为呼吸道疾病/囊性纤维化,来源站为omicsdi.org。
【数据内容】
源站描述表明,该数据集包含对人支气管上皮制备进行的单细胞RNA测序,样本涉及非囊性纤维化与囊性纤维化来源。具体包括:未经处理的BE63非CF细胞、未经处理的BE73 CF细胞,以及经TNFα+IL-17或IFNα处理的BE63非CF细胞。由此可见,数据覆盖了未处理状态下的非CF与CF样本,以及非CF细胞在两种炎症因子刺激条件下的样本,构成疾病背景与刺激条件相互对照的数据内容。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。其测序对象为人支气管上皮制备,测序方式为单细胞RNA测序。样本命名中出现的BE63与BE73分别对应非CF与CF来源的细胞材料。除上述信息外,源站未提供更详细的采集地点、时间、伦理审批及具体测序平台等信息。
【适用场景】
基于其样本构成,该数据集适用于比较非囊性纤维化与囊性纤维化支气管上皮细胞在单细胞转录组层面的差异,也适用于考察非CF上皮细胞在TNFα+IL-17或IFNα刺激下的转录响应。主题标签Transcriptomics表明其用途集中于转录组学分析,可作为呼吸道疾病尤其是囊性纤维化相关气道上皮研究的参考数据。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件格式、分析流程及配套注释信息等。使用者需依据来源站omicsdi.org的相应条目自行获取与处理数据。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、测序深度、细胞数量、重复次数及批次信息等质量评估内容。该数据集样本构成相对有限,仅涉及BE63与BE73两种细胞材料及若干处理条件,相关结论的外推需谨慎。其余质量与限制信息源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE335566
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对来自非囊性纤维化和囊性纤维化样本的人支气管上皮制备物进行了单细胞RNA测序。该数据集包括未处理的BE63非CF细胞、未处理的BE73 CF细胞,以及经TNFα + IL-17或IFNα处理的BE63非CF细胞。
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