非CF与CF样本人支气管上皮制备的单细胞RNA-seq图谱

该数据集来自 omicsdi.org,提供非囊性纤维化(non-CF)与囊性纤维化(CF)样本的人支气管上皮制备的单细胞RNA-seq图谱

omicsdi
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基因组分类Genomics
Single-cell RNA-seq profiling of human bronchial epithelial preparations from non-CF and CF samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

非CF与CF样本人支气管上皮制备的单细胞RNA-seq图谱

该数据集为单细胞RNA-seq图谱资源,聚焦人支气管上皮制备样本,覆盖非囊性纤维化(non-CF)与囊性纤维化(CF)两类样本,可用于在单细胞分辨率下观察支气管上皮细胞的转录组特征。数据集英文名称为“Single-cell RNA-seq profiling of human bronchial epithelial preparations from non-CF and CF samples”,在站内归入呼吸道疾病/囊性纤维化分类,来源站为omicsdi.org,主题标签为Genomics。整体而言,该资源以单细胞转录组为技术主线,围绕囊性纤维化相关气道上皮样本展开,为呼吸道疾病尤其是囊性纤维化方向的研究提供可检索、可复用的数据入口。

【数据集背景】

囊性纤维化是一种累及多系统的遗传性疾病,气道受累是其重要临床特征之一。支气管上皮作为气道屏障与黏液纤毛清除功能的关键组成部分,在疾病机制研究中具有重要地位。单细胞RNA-seq能够在单个细胞层面刻画转录组异质性,有助于区分不同上皮细胞状态与组成差异。该数据集正是面向非囊性纤维化与囊性纤维化样本的人支气管上皮制备,提供单细胞RNA-seq层面的图谱性数据,主题标签为Genomics,站内分类为呼吸道疾病/囊性纤维化。

【数据内容】

该数据集的核心内容为人支气管上皮制备的单细胞RNA-seq图谱,样本覆盖非囊性纤维化(non-CF)与囊性纤维化(CF)两类。源站描述与数据集英文名称一致,均指向上述样本类型的单细胞RNA-seq profiling。除样本类型与单细胞RNA-seq这一技术类型外,源站未提供关于细胞数量、测序平台、基因数目、细胞类型注释、分组重复数等具体指标。主题标签为Genomics,表明其数据属性归属于基因组学范畴。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。源站描述为“Single-cell RNA-seq profiling of human bronchial epithelial preparations from non-CF and CF samples”,与数据集英文名称相同。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、制备流程细节以及测序服务提供方等,源站未提供。数据集的站内分类为呼吸道疾病/囊性纤维化,主题标签为Genomics。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于围绕人支气管上皮的单细胞转录组研究场景,尤其是需要在非囊性纤维化与囊性纤维化样本之间进行比较的分析。典型用途包括:在单细胞层面考察支气管上皮制备中的细胞组成与转录组特征;为囊性纤维化气道上皮相关机制研究提供数据支撑;作为呼吸道疾病/囊性纤维化方向的数据资源用于方法验证或探索性分析。由于源站未提供细胞类型注释、差异分析结果等具体内容,具体分析场景需以实际获取的数据为准。

【使用方法】

该数据集通过omicsdi.org来源站提供,使用者可依据该来源进行检索与获取。关于下载方式、文件格式、数据组织方式、是否提供预处理矩阵或原始测序数据、是否有配套分析代码或可视化工具等,源站未提供。使用时应结合单细胞RNA-seq数据的通用处理流程进行质控、比对或定量、降维聚类与注释等分析,但具体参数与流程需视实际数据情况而定。

【质量与限制】

该数据集的质量控制信息、测序深度、细胞存活率、批次效应评估等,源站未提供。限制方面,源站未提供样本量、重复数、临床元数据以及细胞类型注释等细节,可能影响对非囊性纤维化与囊性纤维化样本间差异的全面解读。此外,数据集聚焦于人支气管上皮制备,是否涵盖其他气道细胞类型或完整组织微环境,源站未提供。使用者应在充分了解数据实际内容的基础上评估其适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用条款,源站未提供。使用者在获取与使用数据前,应自行查阅来源站omicsdi.org上的相关说明,并遵循数据提供方的要求。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1478899

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

Single-cell RNA-seq profiling of human bronchial epithelial preparations from non-CF and CF samples

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