囊性纤维化气道上皮基因表达数据集

该数据集提供囊性纤维化患者与健康对照的气道上皮组织基因表达数据,基于微阵列或转录组测序技术生成,广泛用于疾病机制分析、生物标志物发现及CF相关通路研究。

National Center for Biotechnology InformationNational Center for Biotechnology Information
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)
浏览 18
文本分类Expression profiling by arrayGPL17399606
GEO GSE2052 Cystic Fibrosis Airway Epithelium Gene Expression

基本信息

模态
文本
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-09-21

资源简介

囊性纤维化气道上皮基因表达数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《IPF versus Control》。源站首次发布:Dec 09 200。

【数据内容】

源站原始描述:Archived lung tissues of patients with IPF were obtained from the tissue bank of the Department of Pathology at the University of Pittsburgh. The diagnosis of IPF was confirmed by open lung biopsy. All patients fulfilled the criteria of the American Thoracic Society and European Respiratory Society for the diagnosis of IPF. Normal histology lung tissues resected from patients with lung cancer were used as controls

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL1739、9606。

【适用方向】

文本类数据可用于医学自然语言处理,如命名实体识别、信息抽取与文本分类。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2052

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 06 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2052

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集来自NCBI GEO数据库,包含囊性纤维化患者与正常对照的气道上皮细胞基因表达谱数据,用于分析CF相关的转录组变化与疾病机制研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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