囊性纤维化患者与健康志愿者多组学测序数据集

该数据集来自 omicsdi.org,包含 13 例囊性纤维化(CF)患者和 8 名健康志愿者(HV)的 RNA-Seq、H3K27Ac ChIP-Seq 与 ATAC-Seq 数据,属于呼吸道疾病/囊性纤维化方向的多组学测序资源

omicsdi
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基因组分类Genomics
c25410b1-f0e7-4cda-86da-31a6cbf5bb82 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

囊性纤维化患者与健康志愿者多组学测序数据集

该数据集是一份面向呼吸道疾病中囊性纤维化方向的多组学测序资源,收录于 omicsdi.org,英文标识为 c25410b1-f0e7-4cda-86da-31a6cbf5bb82 - samples。其核心内容是对囊性纤维化患者与健康志愿者样本开展的多层次测序检测,涵盖 RNA-Seq、H3K27Ac ChIP-Seq 与 ATAC-Seq 三类数据,样本来自 13 例囊性纤维化(CF)患者和 8 名健康志愿者(HV)。数据集在主题上归入 Genomics,本站分类为呼吸道疾病 / 囊性纤维化。整体而言,该资源将转录组信息、组蛋白乙酰化修饰信息与染色质可及性信息集中于同一患者—对照框架之下,为在囊性纤维化背景下考察基因表达调控与染色质状态提供了可用的数据基础。

【数据集背景】

囊性纤维化是一种累及呼吸系统的疾病,本数据集即围绕这一疾病方向组织测序数据。数据集将囊性纤维化患者与健康志愿者并置,形成患者组与对照组的基本结构,使研究者能够在同一数据资源内比较两类人群的分子层面特征。数据集的英文名称以样本(samples)为标识对象,说明其组织方式以样本为单位承载测序结果。来源站为 omicsdi.org,该数据集在该平台上以多组学资源的形式呈现,主题标签为 Genomics。

【数据内容】

数据集包含三类测序数据:RNA-Seq、H3K27Ac ChIP-Seq 和 ATAC-Seq。RNA-Seq 用于反映样本的转录本层面信息;H3K27Ac ChIP-Seq 针对组蛋白 H3K27 乙酰化修饰,属于表观遗传修饰的检测;ATAC-Seq 用于检测染色质可及性。三类数据共同覆盖转录活动、活性增强子相关修饰与开放染色质区域等不同层面。样本构成明确为 13 例囊性纤维化患者与 8 名健康志愿者,共计 21 个个体来源的样本。除上述数据类型与样本数量外,源站未提供各数据类型的文件数量、测序深度、读长、基因组版本等具体技术参数。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站对其的描述为:包含 13 例囊性纤维化患者和 8 名健康志愿者的 RNA-Seq、H3K27Ac ChIP-Seq 与 ATAC-Seq 数据。数据集的样本组织方式与英文名称中的 samples 标识一致。关于样本采集的具体机构、采集时间、采集部位、伦理审批信息以及原始数据产生平台,源站未提供。

【适用场景】

基于其数据类型与样本结构,该数据集适用于囊性纤维化相关的多组学比较研究,例如在患者与健康志愿者之间比较基因表达差异、考察 H3K27Ac 修饰分布的变化,以及分析染色质可及性差异;也可用于将转录组、组蛋白修饰与染色质开放状态进行整合分析,探索调控层面的关联。主题标签 Genomics 表明其适用于基因组学范畴的分析工作。关于该数据集在具体疾病机制研究中的既定用途或已发表成果,源站未提供。

【使用方法】

数据集以样本为单位组织,使用者可按患者组与健康志愿者组划分样本,并分别对 RNA-Seq、H3K27Ac ChIP-Seq 与 ATAC-Seq 三类数据进行处理与分析。关于数据下载方式、文件格式、目录结构、配套分析流程或使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

数据集明确给出样本量为 13 例囊性纤维化患者与 8 名健康志愿者,样本规模相对有限。关于数据质量评估指标、批次信息、缺失情况、重复样本设置以及质控结论,源站未提供。使用时应以源站可获取的原始信息为准,对未披露的技术细节不作推断。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001009062

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含13名囊性纤维化(CF)患者和8名健康志愿者(HV)的RNA-Seq、H3K27Ac ChIP-Seq和ATAC-Seq数据。

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