CGD治疗中CYBA和CYBB基因编辑与插入转录组学数据集
本数据集属于前沿基因治疗技术在慢性肉芽肿病中的应用研究数据，包含经过STD_Cas9编辑后的突变细胞株和主细胞基因组测序结果。主要用于评估和分类基因编辑技术的靶向修复效率及脱靶效应，对探索CGD这一罕见免疫缺陷病的根治性疗法具有重要的生物信息学价值。
基本信息
资源简介
CGD治疗中CYBA和CYBB基因编辑与插入转录组学数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Targeted gene editing and near-universal cDNA insertion of CYBA and CYBB as a treatment for chronic granulomatous disease》。源站首次发布：Jan 18 202。
【数据内容】
源站原始描述：Chronic granulomatous disease (CGD) is a severe inborn error of immunity (IEI) caused by defects in the NADPH oxidase. The best current treatment option for patients with CGD, allogeneic hematopoietic stem cell (HSC) transplantation, is associated with severe adverse effects such as graft-versus-host disease, highlighting a need for improved treatment options based on transplantation of autologous ex vivo gene-edited HSCs. Here, we generate CRISPR/Cas9-based gene editing strategies for the corre…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Other、GPL24676、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287370
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 20 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287370
标准获取流程：
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.50 GB。
数据说明
该数据集研究了针对慢性肉芽肿病的靶向基因编辑和近通用cDNA插入技术（CYBA和CYBB基因），提供了使用Cas9等工具处理K562细胞及相关造血干细胞后的基因组学测序和编辑效率评估数据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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