CGD患者肠道微生物组与代谢组特征数据集

该数据集由美国国立卫生研究院(NIH)等机构提供,保存在GEO数据库中。它通过高通量测序和代谢组检测技术,系统展示了慢性肉芽肿病患者在肠道微生物多样性及代谢产物分子层面与健康人群的显著差异,为CGD并发炎症性肠病的机制研究和临床药物靶点筛选提供了多模态开源数据支撑。

National Institutes of Health (NIH)National Institutes of Health (NIH)
Gene Expression Omnibus (GEO)
2023-05-16 更新
浏览 20
多模态分类OtherGPL155209606
Intestinal microbiome and metabolomic signatures in patients with chronic granulomatous disease (GSE220260)

基本信息

模态
多模态
大小
1.2 GB
数据量
104
任务类型
分类
许可
CC0 1.0
创建/更新时间
2023-05-16

资源简介

CGD患者肠道微生物组与代谢组特征数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Intestinal microbiome and metabolome signatures in patients with chronic granulomatous disease》。源站首次发布:Dec 06 202。

【数据内容】

源站原始描述:Background and aims: Gene mutations or variants leading to insufficient reactive oxygen species (ROS) production have been associated with inflammatory bowel disease (IBD). In particular, 40-50% of patients with chronic granulomatous disease have IBD (CGD-IBD). CGD is caused by inherited defects in any one of the 5 subunits forming the nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) oxidase complex 2 (NOX2), leading to severely reduced or absent phagocyte-derived ROS production. While conven…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL15520、9606。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE220260

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 04 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE220260

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.20 GB。

数据说明

该数据集通过对79名CGD患者、8名突变携带者和17名健康对照者的粪便样本进行测序和代谢组学分析,研究NOX2缺陷对肠道微生物群组成和功能的影响,探讨其与CGD相关炎症性肠病(CGD-IBD)的联系。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案