CPTAC肺腺癌蛋白质组数据集

该数据集提供肺腺癌蛋白质组与转录组多组学数据,结合临床信息用于解析肿瘤分子机制、蛋白表达变化及潜在治疗靶点研究。

National Cancer InstituteNational Cancer Institute
CPTAC Data Portal
2023-01-01 更新
浏览 21
多模态分类cancerproteomicsgenomicsimagingmulti-omicsCPTACpan-cancer
CPTAC Lung Adenocarcinoma

基本信息

模态
多模态
任务类型
分类
创建/更新时间
2023-01-01

资源简介

CPTAC肺腺癌蛋白质组数据集

【一句话概览】

Proteomic Data Commons(PDC)提供开放获取的、经过协调的癌症蛋白质组学数据,并通过可视化关联和交叉引用连接基因组学与影像资源,帮助研究人员开展多组学发现。该资源涵盖7346名受试者,相关标签包括癌症、蛋白质组学、基因组学、影像、多组学、CPTAC及泛癌(来源 cptac-data-portal.georgetown.edu)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Proteomic Data Commons (PDC)》。

【数据内容】

源站原始描述:Open access to harmonized cancer proteomic data, with visual connections and cross-references to genomic and imaging resources, helping researchers make multi-omic discoveries

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):开放获取经过协调的癌症蛋白质组学数据,并与基因组学和影像学资源建立可视化关联和交叉引用,帮助研究人员实现多组学发现。

【主题与分类】

主题标签:cancer、proteomics、genomics、imaging、multi-omics、CPTAC、pan-cancer。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://cptac-data-portal.georgetown.edu/

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使用方式

数据集获取

源站:https://cptac-data-portal.georgetown.edu/

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CPTAC肺腺癌数据集提供肿瘤蛋白质组学、转录组学及临床信息,用于研究肺癌蛋白表达变化及其分子机制,是多组学癌症研究的重要资源。

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