EMBARC-BRIDGE 泛欧洲支气管扩张痰液宏基因组分析
数据围绕支气管扩张这一呼吸道疾病，通过痰液宏基因组测序产生原始序列读长，可用于探索患者呼吸道微生物组组成与疾病特征。源站未提供样本量、测序平台、分析流程及具体结论等信息（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
EMBARC-BRIDGE 泛欧洲支气管扩张痰液宏基因组分析
PRJNA1186390 是一个围绕支气管扩张这一呼吸道疾病展开的泛欧洲痰液宏基因组学研究项目，隶属于 EMBARC-BRIDGE 研究。该项目通过痰液宏基因组测序产生原始序列读长，可用于探索患者呼吸道微生物组的组成及其与疾病特征之间的关联。作为 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，它为研究者提供了一个集中获取该项目所产生各类数据链接的入口。需要说明的是，关于该项目的样本量、测序平台、分析流程以及具体研究结论等信息，源站并未提供，因此本介绍仅能依据已知的项目名称、分类与数据类型进行说明。
【数据集背景】
支气管扩张是一种常见的慢性呼吸道疾病，其发生发展与呼吸道微生物组的改变密切相关。EMBARC-BRIDGE 研究是一项泛欧洲范围内的研究工作，旨在通过痰液宏基因组分析，从微生物组角度加深对支气管扩张的理解。该数据集即来源于这一研究计划，属于呼吸道疾病 / 支气管扩张这一分类方向。在 NCBI 的 BioProject 体系中，每一个 BioProject 记录都对应一个由单一机构或联合体发起的生物学数据集合，为用户提供查找该项目所产生各类数据的统一入口。PRJNA1186390 正是这样一个记录，其标题明确指向泛欧洲痰液宏基因组分析这一研究主题。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长。这意味着项目所产生的数据以测序读长形式存在，来源于痰液样本的宏基因组测序。宏基因组测序能够同时捕获样本中多种微生物的遗传物质，因此这些原始读长可用于后续的微生物组组成分析。除原始序列读长这一数据类型外，源站未提供关于数据文件格式、数据量、序列长度分布等更具体的信息。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。项目名称为 PRJNA1186390，与 EMBARC-BRIDGE 研究相关，样本类型为痰液，研究范围覆盖泛欧洲地区。关于样本采集的具体地点、采集时间、纳入人群特征、样本量等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于痰液宏基因组原始序列读长，该数据集可用于探索支气管扩张患者呼吸道微生物组的组成与疾病特征。潜在的应用方向包括微生物群落结构分析、物种组成比较以及微生物组与疾病表型之间关联的探索性研究。由于数据为原始读长，使用者通常需要自行完成质量控制、序列拼接或分类注释等下游分析步骤。需要强调的是，源站未提供该数据集的具体分析流程或研究结论，因此上述适用场景仅为基于数据类型的一般性说明。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 记录访问该项目，并借助记录中提供的链接获取与之相关的各类数据。由于该记录本身是数据链接的集合入口，具体的数据下载方式、文件组织形式以及分析工具的选择，需依据实际获取到的数据内容而定。源站未提供针对该数据集的使用指南或推荐分析流程。
【质量与限制】
该数据集为原始序列读长，尚未经过源站描述中提及的进一步处理或分析。源站未提供关于数据质量、测序深度、覆盖度、污染控制等方面的信息。此外，样本量、测序平台、分析流程及具体结论等信息均未在源站中给出，因此使用者在解读和再利用该数据时需自行评估其适用性与局限性。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可条款以及使用限制，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前，应自行查阅 NCBI 及项目相关方发布的最新政策与要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1186390
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自10个欧洲国家（包括北欧、西欧和南欧地区以及英国）349名支气管扩张患者痰样本的下一代鸟枪法宏基因组测序数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
