哮喘患者肺泡巨噬细胞转录组分析
研究通过分段支气管过敏原激发方案，在激发前和激发后 48 小时采集哮喘受试者的 BAL 液，纯化肺泡巨噬细胞并提取总 RNA，使用 Illumina 系统进行下一代测序，以探究过敏原激发对肺泡巨噬细胞基因表达模式的影响
基本信息
资源简介
哮喘患者肺泡巨噬细胞转录组分析
Transcriptome analysis of alveolar macrophages in asthma
该数据集来自 ebi.ac.uk，属于呼吸系统疾病/哮喘分类，主题标签为 RNA-seq of coding RNA 与 Homo sapiens。研究通过分段支气管过敏原激发方案，在激发前和激发后 48 小时采集哮喘受试者的 BAL 液，纯化肺泡巨噬细胞并提取总 RNA，使用 Illumina 系统进行下一代测序，以探究过敏原激发对肺泡巨噬细胞基因表达模式的影响。数据可用于分析哮喘中过敏原激发前后肺泡巨噬细胞的转录组变化（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：目的：本研究旨在探究人哮喘患者接受过敏原激发后肺泡巨噬细胞基因表达模式的改变。方法：采用分段支气管过敏原激发（SBP-AG）方案，在纳入该方案的受试者中，于过敏原激发前和激发后 48 小时获取 BAL 液。从 BAL 液中纯化肺泡巨噬细胞并分离总 RNA。使用 Illumina 系统生成下一代测序数据。结果：使用优化的数据分析流程，我们将每个样本约 7500 万条序列 reads 比对到人类基因组，并在巨噬细胞 mRNA 中鉴定出 29,691 个转录本。其中，37 个转录本的表达谱变化具有统计学显著性。结论：Th2 细胞因子富集环境会改变表型，这一观点已被广泛接受。
【主题与分类】
主题标签：RNA-seq of coding RNA、Homo sapiens。本站分类：呼吸系统疾病/哮喘。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-65039
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- OpenDataLab:
数据说明
E-GEOD-65039 哮喘中肺泡巨噬细胞的转录组分析 编码RNA的RNA-seq EFO EFO_0003738 智人 目的：本研究旨在探究过敏原激发对人哮喘患者肺泡巨噬细胞基因表达模式的改变。方法：通过使用
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