嗜酸性肉芽肿性多血管炎的表观基因组特征

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06231498

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数据说明

疾病：嗜酸性肉芽肿性多血管炎。背景与依据。嗜酸性肉芽肿性多血管炎（EGPA）是一种罕见的多系统免疫介导性疾病，既归类于抗中性粒细胞胞浆抗体（ANCA）相关性血管炎，也归类于嗜酸性粒细胞增多性疾病。当前科学认识将EGPA描述为一种复杂或多因素性质的疾病，即该病由遗传基因变异与环境因素的共同作用所触发。“表观遗传学”一词指的是基因表达的可遗传改变，而这些改变并不对应于 underlying DNA 序列的变异。在与EGPA相似的各种自身免疫性疾病背景下，以及在哮喘（几乎所有EGPA患者均患有此病）的背景下，多项研究已强调表观遗传学在发病机制/病理生理学中发挥基础性作用，特别是其可能代表环境暴露与遗传相互作用导致疾病的机制。

因此，研究EGPA中的表观遗传学（即以DNA甲基化作为研究最多的表观遗传机制）可有助于深入了解该病理，特别是识别表观遗传标记，这些标记可用于诊断、监测疾病活动性或预测对药物治疗的反应。目的。主要目的是识别甲基化水平与病理相关的位点（即疾病的表观遗传标记）。次要目的是：识别在患病患者中甲基化水平与对药物美泊利珠单抗治疗反应相关的位点（即预测对美泊利珠单抗反应的表观遗传标记）；识别转录水平与疾病相关的基因以及血浆浓度与疾病相关的蛋白质（通过这种方式，我们期望评估表观遗传变异对基因/蛋白质表达的影响，并

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。