儿童发育结局表观遗传时序效应汇总统计
主题标签：DNA甲基化、儿童发育结局、哮喘、meta-regression、PACE、纵向研究。本站分类：呼吸系统疾病/哮喘
基本信息
资源简介
儿童发育结局表观遗传时序效应汇总统计
该数据集为一项关于表观遗传时序效应与儿童发育结局关系的汇总统计资料，英文名称为“Summary statistics for 'Epigenetic timing effects on child developmental outcomes'”。数据集由Neumann, Alexander与Cecil, Charlotte提供，发布于Zenodo平台，发布时间为2024年，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。数据集在分类上归属于呼吸系统疾病下的哮喘类别，主题标签涵盖DNA甲基化、儿童发育结局、哮喘、meta-regression、PACE以及纵向研究。其核心内容围绕出生时或儿童期DNA甲基化与多种儿童健康结局之间的meta回归分析结果，以汇总统计文件形式呈现，旨在为相关领域研究者提供可再利用的分析数据。
【数据集背景】
该数据集来源于对“Epigenetic timing effects on child developmental outcomes: A longitudinal meta-regression of findings from the Pregnancy And Childhood Epigenetics Consortium”研究的汇总统计。该研究关注表观遗传时序效应，即DNA甲基化在出生时或儿童期不同时间点与儿童发育结局之间的关联。研究依托Pregnancy And Childhood Epigenetics Consortium（PACE）的纵向数据，采用meta-regression方法整合多项发现，以探讨甲基化时点对后续健康结局的潜在影响。数据集所属分类为呼吸系统疾病/哮喘，主题标签亦包含哮喘，表明其与呼吸系统健康结局存在关联。作者为Neumann, Alexander与Cecil, Charlotte，机构为Zenodo，发布时间为2024年。
【数据内容】
数据集包含多个文件，每个文件提供一项meta-regression结果的汇总统计。这些meta-regression将出生时或儿童期的DNA甲基化与某一儿童健康结局相关联。所涉及的儿童健康结局包括：注意缺陷/多动障碍症状、一般精神病理因子、睡眠时长、BMI或哮喘诊断。每个数据集包含若干列，已明确提及的列包括cpg（DNA甲基化位点）与estimate_birth（出生时估计值），源站描述在后续内容中被截断，因此其余列的具体名称与含义源站未提供。整体而言，数据内容以汇总统计形式呈现，而非原始个体数据，便于研究者进行二次分析或meta分析。
【采集与来源】
数据来源于doi.org，具体为Zenodo平台收录的汇总统计文件。源站描述指出，这些汇总统计对应的是Pregnancy And Childhood Epigenetics Consortium（PACE）研究中的纵向meta-regression结果。研究全称为“Epigenetic timing effects on child developmental outcomes: A longitudinal meta-regression of findings from the Pregnancy And Childhood Epigenetics Consortium”，相关论文发表于medRxiv，作者包括Neumann, A., Sammallahti, S., Cosin-Tomas, M., Reese, S. E., Suderman, M., Alemany, S., ... & Cecil, C.，年份为2024。数据集的作者为Neumann, Alexander与Cecil, Charlotte，机构为Zenodo，发布时间为2024年。关于样本量、纳入队列的具体数量、甲基化检测平台等采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于表观遗传流行病学、儿童发育与呼吸系统疾病（尤其是哮喘）相关研究。具体场景包括：研究者可利用汇总统计进行二次分析，探讨DNA甲基化时点与儿童健康结局的关联；可将其纳入更广泛的meta分析，以验证或扩展表观遗传时序效应；也可用于方法学比较，例如评估不同meta-regression模型在纵向表观遗传数据中的表现。由于涉及哮喘诊断这一结局，该数据集对呼吸系统疾病领域的研究者具有直接参考价值。此外，主题标签中的PACE与纵向研究提示其适用于多队列整合分析场景。
【使用方法】
使用者可通过doi.org访问Zenodo平台获取数据集文件。每个文件为汇总统计结果，包含cpg与estimate_birth等列，使用者可根据研究问题筛选特定甲基化位点或健康结局。由于数据为汇总统计而非个体数据，分析时需注意其适用于meta分析或汇总数据建模，而非直接进行个体水平回归。若需复现原始研究，应参考Neumann等（2024）的medRxiv论文以了解完整方法。使用时应遵循Creative Commons Attribution 4.0 International许可，适当引用作者与来源。关于软件工具、代码或具体分析步骤，源站未提供。
【质量与限制】
数据集以汇总统计形式发布，其质量依赖于原始meta-regression的严谨性，但源站未提供具体的质量评估指标，如异质性检验、敏感性分析或偏倚评估结果。限制方面，由于仅提供汇总统计，使用者无法直接控制原始数据中的混杂因素或进行个体水平分析；源站描述在列名部分被截断，导致部分列信息不完整，可能影响对数据结构的完整理解。此外，数据集分类为呼吸系统疾病/哮喘，但健康结局还包括注意缺陷/多动障碍症状、一般精神病理因子、睡眠时长与BMI，因此其适用范围超出单一疾病类别。关于样本代表性、人群特征或时间跨度等限制，源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时，应引用作者Neumann, Alexander与Cecil, Charlotte，以及来源Zenodo，发布时间2024年。同时，应引用相关研究论文：Neumann, A., Sammallahti, S., Cosin-Tomas, M., Reese, S. E., Suderman, M., Alemany, S., ... & Cecil, C. (2024). Epigenetic timing effects on child developmental outcomes: A longitudinal meta-regression of findings from the Pregnancy And Childhood Epigenetics Consortium. medRxiv, 2024-02。许可为Creative Commons Attribution 4.0 International，允许共享与改编，但需注明适当署名。关于引用格式的具体要求或附加条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.10720466
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 151.0 MB。
数据说明
“表观遗传时序效应对儿童发育结局的影响：来自孕期与儿童期表观遗传学联盟研究结果的纵向元回归”的汇总统计。每个文件包含一项元回归结果的汇总统计，该元回归将出生时或儿童期的DNA甲基化与儿童健康结局相关联。儿童健康结局包括注意缺陷/多动障碍症状、一般精神病理因子、睡眠时长、BMI或哮喘诊断。详见：Neumann, A., Sammallahti, S., Cosin-Tomas, M., Reese, S. E., Suderman, M., Alemany, S., … & Cecil, C. (2024). Epigenetic timing effects on child developmental outcomes: A longitudinal meta-regression of findings from the Pregnancy And Childhood Epigenetics Consortium. medRxiv, 2024-02。每个数据集包含以下列：cpg DNA甲基化位点；estimate_birth 出生时无甲基化或完全甲基化之间健康结局的SD差异。（哮喘诊断时为对数比值比）；se_birth 标准误；pval_birth p值；estimate_childhood 儿童期无甲基化或完全甲基化之间健康结局的SD差异。
（哮喘诊断情况下的对数几率）se_childhood 标准误 pval_childhood p值 estimate_delta 出生时与儿童期评估的DNA甲基化与健康结局之间关联的变化。se_delta 标准误 pval_delta p值
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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