哮喘小鼠RNA-seq数据集

该数据集来源于ebi.ac.uk,包含TDI诱导的哮喘小鼠肺组织6个样本和HDM/LPS诱导的哮喘小鼠肺组织10个样本的RNA-seq数据

biostudies
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基因组分类Mus musculus (mouse)
RNA-seq of asthmatic mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-29

资源简介

哮喘小鼠RNA-seq数据集

该数据集为来源于 ebi.ac.uk 的小鼠哮喘模型 RNA-seq 数据,主题物种为 Mus musculus(小鼠),归入呼吸系统疾病 / 哮喘分类。数据覆盖两种不同方式诱导的哮喘模型肺组织样本:TDI(甲苯二异氰酸酯)诱导的哮喘小鼠肺组织 6 个样本,以及 HDM/LPS(屋尘螨/脂多糖)诱导的哮喘小鼠肺组织 10 个样本,合计 16 个样本。数据集以转录组测序方式呈现上述模型肺组织的基因表达信息,可用于比较不同诱导因素下哮喘相关肺部转录组特征。以下依据可获得的信息对该数据集作分段介绍,未覆盖之处如实标注。

【数据集背景】

哮喘是一种以气道炎症、气道高反应性等为特征的呼吸系统疾病,动物模型是研究其发病机制与干预靶点的重要工具。不同诱导方式所复现的病理环节和免疫通路存在差异,因此针对多种诱导模型开展转录组水平的观察,有助于从基因表达层面刻画模型间的异同。该数据集以小鼠为实验物种,聚焦哮喘这一呼吸系统疾病主题,提供两种常见诱导方式下肺组织的 RNA-seq 数据,为哮喘相关转录组研究提供数据基础。

【数据内容】

数据集包含两组样本:TDI 诱导的哮喘小鼠肺组织 6 个样本,以及 HDM/LPS 诱导的哮喘小鼠肺组织 10 个样本,共计 16 个样本。数据形式为 RNA-seq,测序对象为肺组织。除样本数量、诱导方式、组织类型与物种(Mus musculus)外,源站未提供关于测序平台、读长、测序深度、表达矩阵或差异分析结果等更细化的内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。样本取材于小鼠肺组织,分别对应 TDI 诱导与 HDM/LPS 诱导两种哮喘模型。关于样本的具体采集流程、诱导剂量与时间安排、动物品系与饲养条件、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据适用于哮喘动物模型肺组织的转录组层面研究,例如比较 TDI 诱导模型与 HDM/LPS 诱导模型之间肺部基因表达特征的差异,或作为哮喘相关基因表达分析的公共数据资源加以利用。由于涉及两种诱导方式,也可用于围绕不同诱发因素所致哮喘的机制探索。更具体的适用分析类型需结合源站提供的原始数据与元数据确定,源站未提供相关说明。

【使用方法】

该数据集可通过 ebi.ac.uk 获取。关于数据的具体下载方式、文件格式、是否提供原始测序读段或处理后表达数据、以及配套的分析流程与参数,源站未提供,使用时需以源站实际提供的内容为准。

【质量与限制】

该数据集样本量有限,TDI 诱导组 6 个样本、HDM/LPS 诱导组 10 个样本,合计 16 个样本。关于测序质量指标、批次信息、重复设置、对照样本情况以及数据完整性评估等,源站未提供。使用时应结合源站元数据核实数据适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与使用许可条款,源站未提供。使用与再分发前应向数据来源站核实相关要求。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-BSST1232

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

S-BSST1232 RNA-seq of asthmatic mice 2026-02-27 RNA-seq of TDI-induced asthmatic mice (lung tissue, 6 samples) and HDM/LPS-induced asthmatic mice (lung tissue, 10 samples). Mus musculus (mouse) CC0 https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/legalcode lung tissue HJWen 739160678@qq.com o1

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