血浆中潜在肺气肿生物标志物的蛋白质组学研究（EmphyseMARK-1）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD074107

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们开展了一项小型横断面蛋白质组学研究，旨在识别肺气肿的潜在生物标志物，以及慢性阻塞性肺疾病（COPD）和吸烟相关的生物标志物。本研究获得了杜布拉瓦大学医院机构伦理委员会的批准（批准号：2022/2908‐05），以及萨格勒布大学医学院机构伦理委员会的批准（批准号：251-59-10106-24-111/119）。本研究共纳入40名参与者，分为四个年龄和性别匹配的等量组（每组N=10名参与者）：1）经胸部CT放射学证实患有肺气肿的COPD患者（CE组），由放射科医生确认；2）经胸部CT无肺气肿放射学征象的COPD患者（CN组），由放射科医生确认；3）健康吸烟者（有主动吸烟史（>20包年）且无呼吸道症状、肺功能正常）（HS组）；4）健康从不吸烟者（无呼吸道症状且肺功能正常）（HN组）。研究流程示意图见图1。

研究参与者以非概率方式纳入（以便在年龄、性别、合并症和体重指数方面进行匹配——从而在这些方面实现组间同质性）。COPD患者（CE组和CN组）为GOLD 2023定义的GOLD 2B期患者，当前吸烟者（>20包年），接受双重吸入治疗（长效β2受体激动剂（LABA）与长效毒蕈碱拮抗剂（LAMA）联合用药）。排除标准为：可逆性气流受限、支气管舒张试验阳性（依据GINA标准或ERS/ATS 2022技术标准）、过去6个月内COPD急性加重、合并恶性肿瘤、自身免疫性疾病或合并哮喘，以及α-1抗胰蛋白酶缺乏症。吸食除传统香烟以外烟草制品（包括电子烟、加热不燃烧烟草制品、雾化器、雪茄和小雪茄）的患者也被排除在研究之外。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。