PRJEB33230:口服鼠李糖乳杆菌GR-1在过敏性哮喘小鼠模型中预防气道功能恶化并促进肠道菌群恢复
过敏性哮喘是一种高发的下气道炎症性疾病,临床特征为气道高反应性、黏液分泌过多及气道功能恶化。具有内在免疫调节特性的益生菌正日益被探索用于预防哮喘发生和减轻哮喘症状,可单独使用或与其他现有治疗(如过敏原特异性免疫治疗)联合使用

基本信息
资源简介
PRJEB33230:口服鼠李糖乳杆菌GR-1在过敏性哮喘小鼠模型中预防气道功能恶化并促进肠道菌群恢复
PRJEB33230 数据集对应一项以小鼠过敏性哮喘模型为对象的实验研究,主题是口服鼠李糖乳杆菌 GR-1 对气道功能与肠道菌群的影响。该研究关注具有内在免疫调节特性的益生菌在哮喘预防中的应用潜力,测试了野生型与重组型鼠李糖乳杆菌 GR-1 菌株作为口服预防性干预手段的效果,其中重组菌株被设计为可产生主要桦树花粉过敏原 Bet v 1。研究结果显示,给予野生型和产 Bet v 1 重组鼠李糖乳杆菌 GR-1 后,气道功能(包括气道高反应性)获得显著改善。该数据集归入呼吸系统疾病 / 哮喘分类,来源为 ebi.ac.uk,可为探索益生菌干预过敏性哮喘的机制与效果提供数据基础。
【数据集背景】
过敏性哮喘是一种高发的下气道炎症性疾病,临床特征包括气道高反应性、黏液分泌过多以及气道功能恶化。当前研究日益关注具有内在免疫调节特性的益生菌,将其作为预防哮喘发生和减轻哮喘症状的潜在手段,既可单独使用,也可与其他现有治疗如过敏原特异性免疫治疗联合使用。在此背景下,该研究以小鼠实验性过敏性哮喘为模型,评估口服益生菌干预对气道功能的影响,并考察肠道菌群的变化,试图为哮喘的预防策略提供实验依据。
【数据内容】
该数据集围绕野生型与重组型鼠李糖乳杆菌 GR-1 菌株的口服预防性给药实验展开。重组菌株的设计特点是能够产生主要桦树花粉过敏原 Bet v 1。研究涉及的主要观察内容包括气道功能指标(如气道高反应性)以及气道炎症相关表现,源站描述中提及气道炎症征象(如气道总……)但该处信息不完整。此外,数据集主题还涉及肠道菌群韧性(gut microbiota resilience)方面的内容。除上述范围外,源站未提供更细化的数据字段、样本数量、测序类型或文件构成说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,英文名称为“PRJEB33230: Oral Lactobacillus rhamnosus GR-1 prevents airway function deterioration and promotes gut microbiota resilience in a mouse model of allergic asthma”。研究采用野生型与重组型鼠李糖乳杆菌 GR-1 菌株,在小鼠过敏性哮喘模型中进行口服预防性干预。关于具体的实验动物品系、给药剂量、干预时长、样本采集流程与测序平台等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病尤其是过敏性哮喘相关的研究场景,可用于探讨益生菌口服干预对气道功能与气道高反应性的影响,也可用于关注肠道菌群与哮喘之间关联的分析。由于涉及产 Bet v 1 的重组益生菌菌株,该数据亦与过敏原特异性免疫治疗相关的益生菌策略研究具有一定相关性。具体适用分析类型需结合源站未提供的完整数据内容判断。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、分析流程或配套工具等信息。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、质控指标或使用限制的说明。需要说明的是,该研究基于小鼠过敏性哮喘模型,其结果外推至人类临床实践时需谨慎。源站描述中关于气道炎症征象的部分内容不完整,可能影响对炎症相关指标的全面理解。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB33230
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
过敏性哮喘是一种高度流行的下呼吸道炎症性疾病,临床特征为气道高反应性、黏液过度分泌及气道功能恶化。具有内在免疫调节特性的益生菌正日益被探索用于预防哮喘发生和减轻哮喘症状,可单独使用或与其他现有治疗方法(如过敏原特异性免疫治疗)联合应用。本研究测试了野生型和经设计可产生主要桦树花粉过敏原Bet v 1的重组益生菌鼠李糖乳杆菌GR-1菌株,作为小鼠实验性过敏性哮喘的口服预防性治疗。给予野生型和产Bet v 1重组鼠李糖乳杆菌GR-1后,气道功能(包括气道高反应性)获得显著改善。产Bet v 1的重组鼠李糖乳杆菌GR-1显著减轻了气道炎症征象(即气道总细胞计数、淋巴细胞计数和肺IL-1b水平),而野生型鼠李糖乳杆菌GR-1的作用较不明显。
有趣的是,并未观察到专门针对2型过敏性致敏或炎症的减少,这提示还有其他机制的参与。此外,哮喘的发生与肠道微生物组组成的改变有关,而这种改变与过敏性致敏、气道炎症及气道高反应性的严重程度相关。重要的是,在接受野生型和重组鼠李糖乳杆菌GR-1的组别中,未观察到这种与哮喘相关的肠道微生物组组成的改变。这些数据表明,鼠李糖乳杆菌GR-1能够预防过敏性哮喘中的气道高反应性,并且产生Bet v 1的鼠李糖乳杆菌GR-1在预防气道炎症方面具有额外效应。鼠李糖乳杆菌GR-1菌株的有益作用与肠道微生物组恢复力的增强相关,而这反过来又与气道功能的保护相关联,并且
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




