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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

喘息儿童病毒性呼吸道感染与口咽微生物组相互作用

PRJEB32061 是一个聚焦于喘息儿童病毒性呼吸道感染与口咽微生物组相互作用的研究项目数据集，其源站标题为“MAVRIC 16S (ID 554822) - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集在本站被归类于呼吸系统疾病 / 哮喘方向，主题标签为“Other”。从整体定位来看，它属于 NCBI BioProject 体系下的一个生物项目记录，旨在汇集与单一研究计划相关的多种生物数据，便于用户在一个统一入口下发现和访问该项目所产生的各类数据链接。该项目的核心关注点在于喘息儿童群体中，病毒性呼吸道感染与口咽部微生物组之间可能存在的相互作用关系，这一主题与呼吸系统疾病及哮喘的研究领域密切相关。

【数据集背景】

该数据集对应的研究计划围绕喘息儿童展开，重点考察病毒性呼吸道感染与口咽微生物组之间的相互作用。喘息是儿童呼吸系统疾病中常见的临床表现，常与哮喘等慢性气道疾病存在关联。病毒性呼吸道感染被认为是诱发或加重喘息症状的重要因素之一，而口咽部微生物组作为呼吸道微生态的重要组成部分，可能在这一过程中扮演调节角色。该 BioProject 记录正是为整合这一研究方向所产生的生物数据而设立。源站描述指出，BioProject 是来自单一组织或联盟的、与单一研究计划相关的生物数据的集合，其记录为用户提供了一个单一位置，用以查找该项目所生成的不同数据类型之间的链接。本站将其归入呼吸系统疾病 / 哮喘分类，并赋予“Other”主题标签，说明其在现有分类体系中暂未归入更细化的特定主题类别。

【数据内容】

该数据集的主题为喘息儿童的病毒性呼吸道感染与口咽微生物组相互作用。源站标题中出现的“MAVRIC 16S”以及“ID 554822”表明该项目涉及 16S 相关数据，通常与微生物组测序分析有关，但具体的数据类型、样本数量、测序平台、序列数量、生物信息学分析结果等细节，源站未提供。BioProject 记录本身并不直接等同于某一类具体数据文件，而是作为项目层面的汇总入口，提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接。因此，该数据集所包含的具体数据内容需通过其 BioProject 记录中的链接进一步获取，源站未提供更详细的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“MAVRIC 16S (ID 554822) - BioProject - NCBI”。其英文名称为“PRJEB32061: Viral respiratory tract infections and oropharyngeal microbiome interactions in wheezing children”。BioProject 记录通常来源于单一组织或联盟，用于汇集与单一研究计划相关的生物数据。关于该项目的具体采集地点、采集时间、样本来源人群、纳入与排除标准、伦理审批信息等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与喘息儿童病毒性呼吸道感染及口咽微生物组相互作用相关的研究场景。由于本站将其分类为呼吸系统疾病 / 哮喘，并带有“Other”主题标签，它可能对呼吸系统疾病、哮喘、儿童喘息、呼吸道病毒感染的微生态研究等方向具有参考价值。BioProject 作为项目级记录，适合用于查找和链接该项目所生成的不同数据类型，帮助研究人员定位相关数据资源。具体的使用场景需结合源站提供的链接和数据说明进一步确定，源站未提供更详细的适用场景描述。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录访问该数据集，利用其提供的单一入口查找该项目所生成的不同数据类型之间的链接。源站描述强调，BioProject 记录为用户提供了一个单一位置来发现与该项目相关的多样化数据类型的链接。因此，使用方法上通常是从该 BioProject 记录出发，跳转至具体的数据资源。关于数据下载方式、分析流程、所需工具、参数设置等具体操作细节，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于项目层面的记录。其质量与限制相关信息，如数据完整性、准确性、样本代表性、测序质量、分析可靠性等，源站未提供。此外，该数据集在本站的主题标签为“Other”，说明其在现有分类体系中未归入更具体的主题类别，这可能对检索和归类造成一定限制。其他潜在限制，源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策等信息，源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 记录及其链接资源中可能附带的引用与许可说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB32061

访问原始数据

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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB32061

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

早期生活中对环境微生物和感染性微生物的暴露被认为是未来疾病易感性的主要风险因素。导致呼吸道喘鸣的急性病毒感染不仅是儿童住院的主要原因，也是哮喘发展的风险因素。为了研究儿童肺部微生物群是否与喘鸣相关，我们采用病毒PCR以及16s rRNA基因定量PCR和测序技术，将珀斯一家儿科医院就诊儿童的呼吸道样本与健康对照进行了比较。喘鸣患者样本与健康对照之间未观察到细菌多样性的显著差异。在喘鸣队列中，参加幼儿园或学前班与细菌多样性增加相关。细菌生物量是解释β多样性变异的重要因素。人鼻病毒（HRV）感染对细菌α或β多样性未发现显著影响。在HRV-A和HRV-C之间观察到细菌丰富度的显著差异，但这很可能是由于两个患者队列之间年龄组的差异所致。

随机森林模型未能成功预测该数据集中与喘息或病毒感染相关的个别OTU，原因在于细菌群落的变异性。肺部细菌群落被发现具有多样性和异质性。年龄以及与日托或幼儿园儿童的接触是驱动细菌多样性的重要因素。然而，喘息和病毒感染并未显示出细菌群落的显著差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别